Материал: Шмид Р. Наглядная биотехнология и генетическая инженерия

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам
Концентрация продукта

Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»

Кинетика роста в реакторе периодического действия

Кривая роста культуры

 

Кинетика роста в экспоненциальной фазе

 

 

 

клеток

 

Лаг-фаза

Переходная фаза I

Фаза экспоненциального роста

Переходная фаза II

Стационарная фаза

Фаза отмирания

Логарифм числа

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Кинетика роста во время переходной фазы II

Уравнение Моно для роста, ограниченного количеством субстрата

Время удвоения

 

 

Время генерации

 

Скорость

 

клеточной

 

 

 

 

 

 

 

деления

 

 

 

 

 

 

 

 

популяции

 

 

 

 

 

 

клеток

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Время

μ

max

, ч–1

t

D

, ч

 

ν

=

скорость деления, ч–1

 

 

 

 

 

μ

=

скорость роста, ч–1

Escherichia coli, 35°С

> 2

 

< 0,35

 

μmax =

максимальная скорость роста, ч–1

Saccharomyces cerevisiae, 35°С

0,6

 

1,2

 

N

=

число клеток, б/р

 

 

X

=

биомасса, г/л

 

 

 

 

 

 

 

Aspergillus niger, 30°С

0,2

3,5

 

S

=

концентрация лимитирующего субстрата, моль/л

Penicillium chrysogenum, 25°С

0,12

5,7

 

KS

=

константа насыщения (константа Моно), моль/л

 

t

=

время, ч

 

 

 

 

 

 

 

Образование продукта

 

 

 

 

 

Максимальная

 

 

[P]

 

 

 

 

продуктивность

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Образование

Продуктивность

 

 

 

 

 

 

 

продукта

 

 

 

 

 

Общая

 

Прекращение образования продукта

 

 

 

 

 

продук-

 

 

 

 

 

 

тивность

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Время, ч

Промывание

 

Лаг-фаза

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

реактора

 

 

 

 

 

 

 

 

Добавление культуры

Фаза образования

 

и питательных веществ

 

продукта

 

 

Продуктивность

Объем Время ферментации, ед./(л час)

Экономические коэффициенты

Образование биомассы , б/р Расход субстрата

Образование биомассы , б/р Потребление кислорода

Образование биомассы

Выделение тепла

, кг/кДж

Типы ферментации

Тип I

Тип II

Тип III

Время

Скорость роста μ

Расход субстрата

Образование продукта

Метаболиты

 

 

Тип I

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Тип II

 

 

 

Тип III

 

Субстрат

 

 

Продукт

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Продукты

Субстрат

 

Рост клеток до конца лаг-фазы

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

или

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

первичного

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

обмена

 

 

 

 

 

Субстрат

Продукт

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Субстрат

 

 

Продукт

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Продукт

 

 

вторичного метаболизма

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Примеры: пекарские

 

Примеры: лимонная кислота,

Примеры: антибиотики, витамины, ферменты

дрожжи, этанол,

 

аминокислоты

 

 

 

 

 

глюконовая кислота

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

205

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

методов

Периодическая ферментация с добавлением субстрата

и непрерывная ферментация

 

ВВЕДЕНИЕ. Периодическое добавление субстрата

наблюдаются различные условия: динамика измене-

биотехнологических

в биореактор позволяет увеличить продолжитель-

ний состава питательной среды, концентрации био-

ность экспоненциальной фазы, во время которой

массы и продукта аналогична тому, что происходит

 

 

синтезируются большинство белковых продуктов, по-

при периодической ферментации в различные про-

 

этому в современной промышленности этот тип фер-

межутки времени. В стационарном состоянии рост

 

ментации находит все большее применение. Непре-

биомассы поддерживается на постоянном уровне

 

рывная ферментация имеет важное значение для

благодаря удалению клеточной суспензии из реакто-

 

изучения закономерностей клеточного роста и мета-

ра. Концентрация субстрата S и скорость образова-

 

болизма, однако в промышленных целях применяет-

ния продукта Qx остаются постоянными. В этих усло-

 

ся очень редко.

виях, если скорость образования продукта не зависит

 

ПЕРИОДИЧЕСКАЯ ФЕРМЕНТАЦИЯ С ДОБАВЛЕНИЕМ

от скорости роста клеток, можно считать, что ско-

Основы

СУБСТРАТА (FED BATCH). Этот тип ферментации

рость образования продукта Qx пропорциональна ско-

имеет два важных преимущества. Многие ценные

рости прохождения клеток через реактор. Если целе-

 

 

продукты (антибиотики, внеклеточные ферменты, по-

вой продукт является продуктом вторичного обмена,

 

лисахариды и др.), получаемые при промышленном

т. е. процессы роста биомассы и синтеза продукта

 

культивировании микроорганизмов, являются вторич-

являются сопряженными, математическая модель

 

ными метаболитами, т. е. синтезируются по оконча-

процесса непрерывной ферментации значительно ус-

 

нии экспоненциальной фазы роста клеток. Для того

ложняется. Непрерывная ферментация имеет очень

 

чтобы восполнять истощившуюся к этому времени пи-

важное значение для подбора и усовершенствования

 

тательную среду, в нее необходимо добавлять свежие

условий промышленной ферментации, а также для

 

питательные вещества, а также вещества-предшест-

изучения влияния пониженного содержания опреде-

 

венники продукта. Периодическое, а не разовое вве-

ленного компонента среды на клеточный рост. В про-

 

дение глюкозы предотвращает замедление роста в

мышленности непрерывная ферментация не находит

 

результате так называемого ингибирования избытком

широкого применения, однако эти процессы исполь-

 

субстрата. Процесс биосинтеза антибиотиков часто

зуются при аэробной или анаэробной очистке сточ-

 

зависит от скорости образования некоторых катабо-

ных вод, а также в пивоварении и производстве чело-

 

литов, поэтому для высокой эффективности синтеза

веческого инсулина с помощью рекомбинантных

 

необходимо в определенной мере ограничивать дос-

штаммов дрожжей. По сравнению с периодической

 

тупность тех или иных источников углерода, азота и

ферментацией непрерывная ферментация имеет

 

фосфора. Такая регуляция становится возможной при

ряд недостатков: a) экономические преимущества

 

осуществлении периодической ферментации с добав-

непрерывного процесса проявляются лишь через

 

лением субстрата. При культивировании пекарских

500–1000 часов ферментации, однако затраты на

 

дрожжей в питательной среде с высоким содержани-

поддержание стерильности реактора в течение столь

 

ем сахара наблюдается высокая удельная скорость

продолжительного времени могут оказаться весьма

 

роста , однако из-за интенсивного образования эта-

значительными; б) контроль и поддержание однород-

 

нола рост клеток при аэробной ферментации замед-

ного состава питательной среды в течение длитель-

 

ляется (так называемый эффект Крэбтри). Если це-

ного периода также требуют дополнительных мер; в)

 

лью периодической ферментации является получение

далеко не все рекомбинантные штаммы, использу-

 

биомассы дрожжей, необходимо избегать аэробных

емые в промышленности, сохраняют свои генетиче-

 

условий и постепенно добавлять глюкозу.

ски запрограммированные свойства в течение про-

 

НЕПРЕРЫВНАЯ ФЕРМЕНТАЦИЯ. При непрерывной

должительного времени.

 

ферментации в культуру постоянно подают свежие

 

 

питательные вещества и одновременно из нее отво-

 

 

дится такой же объем клеточной суспензии. Непре-

 

 

рывную ферментацию можно проводить в реакторе с

 

 

постоянной скоростью подачи питательных веществ

 

 

(хемостате), в реакторе, в котором поддерживается

 

 

постоянное количество клеток (турбидостате) или в

 

 

реакторе идеального вытеснения (plug-flow), в кото-

 

 

ром суспензия клеток направленно поступает в реак-

 

 

тор, а на выходе удерживается и вновь подается на

 

 

вход. Использование реакторов идеального вытесне-

 

206

ния особенно важно при подборе оптимальных усло-

 

вий ферментации. В разных участках реактора

 

Copyright ОАО «ЦКБ «БИБКОМ» & ООО «Aгентство Kнига-Cервис»

Непрерывная ферментация

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Типы реакторов

 

 

 

 

Скорость разведения и выход продукта

 

 

Хемостат

Турбидостат

Реактор идеаль-

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

ного вытеснения

5

 

10

 

 

 

 

5

 

Продукт

Продукт

Продукт

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Измерение

 

 

 

4

 

8

 

 

 

 

4

 

 

оптической

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

плотности

 

Рециркуляция клеток

 

 

 

 

 

 

 

 

 

DX, г/(л ч)

 

 

 

X, г/л

3

 

6

 

 

 

, ч

3

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

D

 

 

 

 

2

 

4

 

 

 

t

2

 

 

 

 

 

S,г/л

 

 

 

 

 

 

 

1

 

2

 

 

 

1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

0,25

0,50

0,75

1,00

 

 

 

Питательная

Питательная

Питательная

 

 

 

Скорость разведения, ч–1

 

 

 

среда

среда

среда

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(постоянная

(постоянная

(постоянная

 

 

 

концентрация субстрата, г/л

 

 

скорость

клеточная

скорость

 

 

 

 

биомасса, г/л

 

 

 

 

поступления)

масса)

поступления)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

время удвоения, ч

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

скорость образования клеток, г/(л ч)

 

Уравнения, описывающие превращения биомассы и субстрата

 

 

 

 

Биомасса

 

 

 

 

 

 

 

экономический коэффициент,

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

б/р

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

константа Моно, г/л

 

 

Субстрат

 

 

 

 

 

 

 

концентрация субстрата

 

 

 

 

 

 

 

 

 

на входе, г/л

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

концентрация субстрата

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

в ферментере, г/л

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

cкорость разведения, ч–1

 

 

В стационарной фазе:

 

 

 

 

 

 

биомасса, г/л

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

скорость роста клеток, ч–1

 

 

 

и μ = D

 

 

 

 

 

 

максимальная скорость

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

роста клеток, ч–1

 

 

 

следовательно

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Периодическая ферментация

 

Образование пенициллина

 

 

 

 

 

 

Биореактор

 

 

 

 

 

 

при периодическом добавлении глюкозы

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

пенициллина, ед./л

 

Добавление

 

 

 

Добавление глюкозы, г/(л ч)

 

 

 

 

 

160

глюкозы

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Резервуар

 

 

120

 

 

Пенициллин

 

50

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

для субстрата

Контроль

 

Концентрация

80

 

 

 

 

 

40

Концентрация биомассы, г/л

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

по принципу

 

 

 

 

 

 

 

30

 

 

 

обратной

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

связи*

 

40

 

Биомасса

 

 

20

 

 

 

Детектор

 

 

 

 

 

 

 

10

 

 

 

 

0

 

 

 

 

 

0

 

 

 

 

 

 

 

24

72

128

168

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

* например, по массе

 

 

 

 

 

Время, ч

 

 

 

 

207

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Основы биотехнологических методов

208

Технология ферментации

ВВЕДЕНИЕ. Правильный расчет конструкции биореактора так же важен для осуществления экономически выгодного процесса ферментации, как и сведения о биологических характеристиках используемых микроорганизмов, полученные при биологических и биохимических исследованиях. Основные цели усовершенствования биореакторов заключаются в повышении безопасности проведения ферментации и минимизации промышленных затрат. При оптимизации конструкции биореактора рассматриваются следующие наиболее важные аспекты: 1) перемешивание среды роста микроорганизмов; 2) соблюдение температурного режима и 3) снабжение клеток кислородом в случае аэробной ферментации.

ПЕРЕМЕШИВАНИЕ в биореакторе осуществляется с помощью механического устройства или путем пропускания воздуха или другого газа. При перемешивании возникают турбулентные потоки, которые можно математически описать, используя число Рейнольдса (Re). Значение числа Рейнольдса обратно пропорционально вязкости среды – параметра, который в случае образующих мицелий организмов зависит от стадии роста микроорганизма и от концентрации продукта в среде. Наиболее наглядна зависимость скорости турбулентных потоков от количества продукта в среде в случае получения ксантановой смолы. Биореактор идеального перемешивания – это математическая модель, которую используют для изучения закономерностей роста микроорганизмов в биореакторе. В этом идеализированном случае считается, что концентрация любого компонента среды одинакова во всем объеме реактора, т. е. среда абсолютно гомогенна. На практике такая ситуация недостижима, так как любой биологический материал не идеальная жидкость: так, клетки мицелия весьма чувствительны к механическому воздействию, поэтому необходимо подбирать условия, обеспечивающие наиболее эффективное перемешивание и в то же время сохраняющие жизнеспособность биологического материала. На эффективность перемешивания влияет множество факторов: форма реактора, конструкция мешалок, их число и скорость вращения для реакторов с механическим перемешиванием или способ подачи газа (барботажная колонна или инжекторная подача) и конструкция насосов для аэроперемешивания. Число Ne – коэффициент мощности – отражает потребление энергии в процессе перемешивания содержимого реактора. В случае, когда через среду не пропускают газ, значение Ne связано с числом Рейнольдса. Для перемешивания в промышленных биореакторах разработано несколько конструкций, позволяющих эффективно проводить аэрацию и перемешивание. К таким устройствам относятся, например, крыльчатые диски и турбинные мешалки.

Эффективность перемешивания описывается объемным коэффициентом массопередачи kLa.

ПОДДЕРЖАНИЕ ПОСТОЯННОЙ ТЕМПЕРАТУРЫ – необходимое условие для оптимального течения процесса ферментации. При росте микроорганизмов высвобождается большое количество энергии в виде тепла, перемешивающие устройства также выделяют тепло. Кроме того, определенный вклад вносят процессы общей теплопередачи и теплообмена на границах фаз. Обычно системы охлаждения с помощью змеевиков или охлаждающих рубашек достаточно для поддержания температуры ферментации на определенном уровне. Однако в некоторых случаях, например при использовании в качестве источников углерода алканов или метанола, требуются дополнительные устройства для охлаждения реактора.

АЭРАЦИЯ. Рост аэробных организмов замедляется, если концентрация кислорода в среде ниже некоторого критического значения. При подборе оптимальных условий аэрации учитывают биологические и технические особенности ферментации. Во-первых, оптимальная скорость переноса кислорода в реакторе зависит от максимальной скорости потребления кислорода микроорганизмами. Во-вторых, не следует забывать о том, что кислород в условиях ферментера находится в трехфазной системе (газ–питатель- ная среда–клетка), и транспорт в такой сложной системе также должен быть оптимизирован. Общее сопротивление обмену кислорода складывается из отдельных сопротивлений в последовательных процессах переноса кислорода от газового пузырька до клетки: 1) диффузия газа к границе раздела фаз газ–жидкость; 2) перенос через границу раздела фаз газ–жидкость; 3) транспорт через жидкость к микроорганизму; 4) транспорт внутри клетки. В случае одноклеточных микроорганизмов на скорость переноса кислорода значительно влияет скорость диффузии кислорода к скоплениям клеток или мицелию. На процесс транспорта кислорода в жидкости влияет множество факторов: 1) технологические (размер реактора, заполненность реактора, эффективность перемешивания, интенсивность аэрации); 2) физикохимические (плотность и вязкость среды, температура, поверхностные свойства (необходимо добавление пеногасителей!)); 3) биологические характеристики микроорганизма (форма клеток). Важный показатель массообмена кислорода kLa можно измерить экспериментально.

Перемешивание в реакторе

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Мешалка типа MIG

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Мешалка типа

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Inter-MIG

 

Крыльчатые диски

 

 

Турбинные мешалки

 

 

 

Характеристики турбулентных потоков

 

Число Рейнольдса (Re)

 

 

 

 

 

Re =

Сила инерции

=

d

2

(безразмерная величина)

 

 

Вязкость

 

R

 

 

 

 

 

η

 

 

 

 

 

 

 

 

Потребление энергии

 

Показатель мощности (Ne)

 

 

 

 

Ne =

 

Сила тяги

=

 

Po

(безразмерная величина)

 

Сила инерции

dR5n3ρ

 

dR

=

Диаметр мешалки, м

η

=

Динамическая вязкость

 

n

=

Скорость вращения

 

 

раствора, Па с

Подача воздуха

Подача воздуха

 

мешалки, с–1

 

 

Po

=

Мощность мешалки, Вт

 

 

 

 

 

ρ

=

Плотность, кг/м3

Системы аэрации реакторов

Перфорированное

Перфорированная

Инжектор

Мешалка с устройством

кольцо

пластина

 

для аэрации

 

 

 

Газ

Жид-

 

 

Жид-

кость

 

 

кость

 

 

Газ

 

Газ

Газ

 

Жидкость

 

 

 

 

 

 

 

 

Потребность в кислороде

 

 

 

Скорость поглощения кислорода

 

QO

 

= XqO

 

= kLa (CO* – CO ), моль/(л ч)

qO2

= qO2max

CO

2

, моль/(л ч)

 

 

 

 

2

 

2

2

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

KO2

+ CO2

 

 

q

 

max = Максимальная скорость поглощения

 

 

 

 

 

 

 

O2

кислорода, моль/г ч

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CO2

= Концентрация растворенного кислорода, моль/л

qO2

= Скорость поглощения кислорода, моль/г ч

C

* = Насыщающая концентрация кислорода, моль/л

 

 

 

= Объемный коэффициент массопередачи (kLa), ч–1

 

O2

 

 

 

 

 

 

 

kLa

K

O2

= Константа Михаэлиса для О

, моль/л

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2

 

 

X= Концентрация биомассы, г/л

 

Кислородный обмен:

 

 

 

 

Объемная скорость подачи воздуха

 

 

 

коэффициент массопередачи kLa

 

 

 

 

Объем воздуха

 

 

P α

B =

 

, мин–1

 

 

Емкость реактора мин

 

kLa =

 

(uG0)β, ч–1

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

VR

Показатель аэрации (NВ)

 

k, α, β = Константы (безразмерная величина)

NB =

 

VG

(безразмерная величина)

 

ndR3

 

P

= Мощность мешалки, Вт

 

 

 

 

 

 

 

VG

= Скорость потока газа, м3

 

VR

= Объем реактора, м3

n

= Скорость вращения мешалки, с–1

 

uG0

= Скорость подачи газа, м/с

dR

=

Диаметр мешалки, м

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

209