Материал: Шмид Р. Наглядная биотехнология и генетическая инженерия

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

методов

Промышленные процессы ферментации

ВВЕДЕНИЕ. Переход от процесса, разработанного

300 л, а в промышленности применяются реакторы с

биотехнологических

в лаборатории, к промышленному производству не

рабочим объемом до 500 м3. При ферментации в

сводится к простому увеличению масштаба. В зави-

больших объемах значительными оказываются энер-

 

 

симости от технологического процесса используются

гетические затраты на обеспечение быстрого пере-

 

различные конструкции биореакторов, среди которых

мешивания среды и отвода тепла для сохранения по-

 

наибольшее

распространение получили

реакторы

стоянной температуры. В масштабных производствах

 

с перемешиванием. Обычно процесс перехода к

(например, производстве глутаминовой кислоты,

 

большим объемам производства осуществляется по-

белков одноклеточных организмов или при очистке

 

этапно (30 л → 300 л → 3000 л → промышленные

стоков) используют эрлифтные реакторы объемом до

 

масштабы).

 

 

 

1500 м3, в которых аэрация осуществляется за счет

 

МАСШТАБИРОВАНИЕ. Уже на уровне эксперимен-

внутренней или внешней рециркуляции газа.

Основы

тальных цехов биореакторы снабжены мешалками,

КОНТРОЛЬНО-ИЗМЕРИТЕЛЬНАЯ АППАРАТУРА. Конт-

турбинами, насосами и специальными устройствами

роль условий культивирования необходим и в экспе-

 

 

для аэрации. Все эти инженерные приспособления

риментальных установках для подбора оптимальных

 

необходимы для создания оптимальных условий

параметров, и в ходе производственного процесса.

 

культивирования клеток. При переходе к промышлен-

Обычно измеряют следующие характеристики: вес

 

ным масштабам производства необходимо учиты-

клеточной массы, температуру культуральной жидко-

 

вать, что в больших реакторах время перемешивания

сти, скорость вращения и потребляемую мощность

 

должно быть значительно увеличено. Для того чтобы

перемешивающих устройств, содержание кислорода и

 

в реакторе объемом более 150 м3 достичь обычной

рН среды. Часто в отработанных газах анализируют

 

для небольших объемов скорости вращения мешал-

содержание СО2 (методом ИК-спектроскопии) и О2

 

ки, потребуются огромные энергозатраты. Из этих же

(методом парамагнитного резонанса). По результа-

 

соображений крайне редко в промышленности ис-

там всех анализов получают полную картину техноло-

 

пользуют рекомбинантные организмы, содержащие

гического процесса. Состав продукта и расход суб-

 

плазмиды с промотором фага λ: при повышении

страта определяют путем периодического отбора проб

 

температуры, что необходимо для индукции генов

без нарушения стерильности системы. Из-за больших

 

под λ-промотором, может нарушить стабильное те-

затрат на проведение ферментации и высоких цен на

 

чение процесса в большом реакторе. При расчете па-

сырье, ведется постоянный поиск возможностей для

 

раметров аэрации учитывают повышенную чувстви-

снижения затрат (технологический процесс получения

 

тельность клеток стрептомицетов, Aspergillus и

продукта с рыночной ценой около 10 евро/кг в фер-

 

Penicillum к механическому воздействию. Аналогич-

ментере объемом 100 м3 с выходом продукта 100 г/л

 

ные аспекты принимают во внимание, когда рассмат-

обходится в 100 000 евро).

 

ривают прохождение газа через среду, а также отве-

ПРОБЛЕМА ПЕНООБРАЗОВАНИЯ В ФЕРМЕНТЕРАХ.

 

дение образовавшегося

тепла с

помощью

Интенсивная аэрация жидких сред, содержащих бел-

 

теплообменников.

 

 

ки, часто сопровождается нежелательным пенообра-

 

ТИПЫ БИОРЕАКТОРОВ. Первыми в промышленности

зованием. Для предотвращения этого обычно ис-

 

были применены поверхностные реакторы (для про-

пользуют механические сбиватели пены, а при

 

изводства лимонной кислоты) и пленочные биореак-

образовании слишком большого количества пены в

 

торы (биофильтры для аэробной очистки сточных

среду добавляют химические пеногасители (напри-

 

вод). Такие конструкции относительно просты в экс-

мер, эруковую кислоту или силиконы). Однако следу-

 

плуатации, однако удельный выход продукта невелик.

ет помнить, что присутствие химических реагентов

 

В современной промышленности наибольшее рас-

может значительно усложнять процедуру очистки

 

пространение получили реакторы с перемешивани-

продукта, поэтому стараются использовать мини-

 

ем, снабженные системой контроля температуры и

мальные количества пеногасителей.

 

интенсивности аэрации, вентилями для отбора проб и

 

 

стерильными

элементами

конструкции (трубы

 

 

и т. д.). В процессах с многоступенчатой фермента-

 

 

цией используются реакторы с лопастными мешалка-

 

 

ми, а в случае одноклеточных организмов эрлифт-

 

 

ные реакторы или барботажные колонны. При

 

 

производстве уксусной кислоты и аэробной очистке

 

 

сточных вод применяют мешалки, засасывающие

 

210

воздух при вращении. Реакторы для исследователь-

 

ских целей, как правило, имеют объем не более

 

Типы биореакторов

 

 

 

Поверхностный биореактор

Реакторы с механическим перемешиванием

Подача

 

Турбинная

С внутренними

Мешалка, засасывающая

влажного

Выход

мешалка

трубками

воздух при вращении

воздуха

воздуха

Газ

 

Газ

 

 

Газ

Газ

 

 

 

 

 

 

 

Пере-

 

 

 

 

город-

 

 

 

 

ка

Пластины

 

 

 

 

с питательной средой

 

 

Мотор

 

 

 

Газ

 

 

 

 

 

 

 

Обычно такие реакторы имеют объем до 150 м3

Барботажные колонны, эрлифтные реакторы и реакторы с внутренним контуром

Барботажная

Эрлифтный

Реактор с внутренним

Реактор с внешней

колонна

реактор

контуром

 

рециркуляцией

Газ

Газ

Газ

 

Газ

 

Пере-

 

 

Пере-

 

город-

 

 

город-

 

ка

 

 

ка

 

 

 

 

L

Газ

Газ

 

Газ

Газ

 

 

Такие реакторы обычно имеют объем >150 м3

 

 

 

Скорость перемешивания в реакторах разного объема

 

Объем биореактора, л

3

9

100

300

1 000

3 000

24 000

Скорость вращения мешалки, об/мин

750

2 000

230

350

200

180

30

Время перемешивания, с

5

3

6,6

5

25

20

66

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Параметры процесса ферментации

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Физические параметры

 

Химические параметры

 

Биологические параметры

 

 

 

Температура

Величина рН

Активность ферментов

 

 

Давление

Растворенный кислород

Содержание АТФ

 

 

Потребляемая мощность

Содержание О2 и СО2

Содержание НАДФ

 

 

Вязкость

в отработанных газах

Содержание белков

 

 

Скорость прохожения газа

Редокс-потенциал

 

 

 

 

Поступление среды

Концентрация субстрата

 

 

 

 

Оптическая плотность среды

Концентрация продукта

 

 

 

 

Вес ферментера

Концентрация ионов

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Красным обозначены параметры, значение которых можно регулировать

 

 

211

 

 

 

 

 

 

 

 

Основы биотехнологических методов

Культивирование животных клеток

ВВЕДЕНИЕ. В промышленности животные клетки культивируют с целью получения вакцин или белков для фармацевтического или диагностического применения, которые нельзя получить в клетках микроорганизмов. Невозможность получения этих белков в виде рекомбинантного продукта микробной ферментации может объясняться несколькими причинами: структура белка стабилизируется большим количеством дисульфидных связей, белок приобретает активность только после посттрансляционных модификаций, неправильное гликозилирование приводит к развитию иммунной реакции. В качестве примеров таких белков можно привести терапевтические антитела, фактор VIII, эритропоэтин и тканевой активатор плазминогена. Культивирование животных клеток с целью получения определенного продукта – чрезвычайно трудоемкая и дорогая процедура. Поэтому ведутся поиски альтернативных путей получения определенных белков с использованием трансгенных животных и растений. В настоящее время ведется активное изучение условий культивирования клеток человека с целью получения тканей для трансплантации и тестирования действия лекарств.

КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК ЧЕЛОВЕКА. В последние десятилетия культивирование клеток человека активно применяется для обнаружения вирусов, а также для разработки противовирусных вакцин. Клетки определенной ткани человека, полученные от донора и размножившиеся в питательной среде, можно заморозить и хранить в морозильных установках при –120 °С. Так создаются целые банки клеток различных тканей, как здоровых, так и имеющих определенную патологию. После того как клетки отобрали из банка, они сохраняют жизнеспособность в жидкой среде на протяжении около 50 циклов деления. Затем такие «первичные» клетки необходимо поместить на твердую питательную среду. Таким образом, процесс культивирования клеток человека для получения определенного продукта имеет строгие ограничения. По самым последним данным, удалось совместно культивировать клетки различных типов, что в перспективе может привести к созданию искусственных тканей (например, кожи). Методы «тканевой инженерии» имеют большие перспективы для своего использования. Наибольший интерес вызывает культивирование стволовых клеток человека, способных при созревании превращаться в любые клетки организма.

нестрогие требования к условиям культивирования;

3)при этом в отличие от «первичных» клеточных культур, которые растут в суспензии, и может быть достигнута высокая плотность культуры (это свойство позволяет культивировать клетки в биореакторах);

4)легко трансформируются. Для производства белков в промышленности используют клетки следующих типов: 1) гибридомные клетки применяют для получения моноклональных антител (в основном для диагностики); 2) фибробласты клеток яичника китайского хомячка (клетки СHO); 3) опухолевые клетки из почек сирийского хомячка (клетки ВНК).

ВЕКТОРЫ ДЛЯ КЛОНИРОВАНИЯ. Клонирование генов

вживотных клетках проводят с использованием специально сконструированных векторов. ДНК этих векторов обладает способностью встраиваться в геном хозяйской клетки и использовать имеющиеся промоторы. Обычно используют челночные векторы, которые перед внесением в животную клетку можно оптимизировать, например, в клетках E. coli. В качестве селективного маркера, указывающего на наличие вектора в геноме животной клетки, в конструкцию вводят ген, продукт которого обезвреживает токсичные для обычных клеток вещества, например неомицин или соли кадмия. Векторы для промышленного культивирования клеток обычно несут ген дигидрофолатредуктазы: при встраивании вектора в геном клеток, не обладающих этим ферментом (например, штамм СНО-К1), они приобретают способность расти на среде с метотрексатом. Этот аналог фолиевой кислоты ингибирует синтез тимидина в dhfr-отрицательных клетках. Таким образом, ауксотрофные по тимидину dhfr-отрицательные клетки в результате трансфекции могут расти на минимальной среде в присутствии метотрексата, размножаться и продуцировать белок, ген которого клонирован в челночный вектор. Известны примеры промышленных векторов, продуцирующих тАП и фактор VIII в клетках CHO.

ЛИНИИ КЛЕТОК. Для получения белков, имеющих терапевтическое значение, как правило, используют хорошо охарактеризованные линии клеток млекопитающих. Они обладают способностью к безграничному делению и проявляют следующие свойства: 1) ко-

212 роткое время генерации (20–30 ч); 2) относительно

Часто используемые линии животных клеток

 

 

Обозначение

Источник

Область использования

клеточной линии

 

 

 

NIH3T3

Фибробласты мыши

Изучение процесса онкогенеза

BHK

Почка сирийского хомячка

Рекомбинантные белки

CHO

Яичник китайского хомячка

тАП, фактор VIII, эритропоэтин и др.

SP 2/0

Миелома мыши

Моноклональные антитела

BS-C-1

Почка зеленой мартышки

Человеческие вакцины

Использование животных клеток для получения полезных продуктов

 

 

«Полезные» качества:

1 мкм

 

бессмертность

 

 

 

 

легкость проведения

 

 

 

трансформации

 

 

возможность роста

 

 

 

в суспензии с высокой

 

 

 

плотностью клеток

 

 

высокая скорость

 

 

 

деления клеток

 

 

нестрогие требования

 

 

 

к условиям среды

 

 

клетка СНО

Примеры векторов для экспрессии в клетках СНО

 

 

 

colE1-ori

 

 

 

Ген устойчивости к тетрациклину

 

 

 

Участок начала репликации

 

 

pRXPy VIII-1

и энхансер вируса полиомы

 

pPADHFR

 

 

фактор VIII

Поздний промотор аденовируса

 

тАП

 

Первый экзон аденовируса

 

 

 

(поздние гены)

 

 

 

Следующий за первым экзоном

 

 

 

интрон с 5'- и 3'-сайтами

Ген устойчивости к ампициллину

 

сплайсинга

 

colE1-ori

 

кДНК фактора VIII

 

Ранний промотор вируса SV40

 

 

 

кДНК ДГФР

кДНК тканевого активатора

 

Ранний терминатор вируса SV40

плазминогена (тАП)

 

Терминатор HBsAg

 

 

 

 

кДНК ДГФР

Селективные маркеры и маркеры амплификации вектора

 

 

 

Маркерные гены

Компонент среды

Селекция/амплификация

Применение

 

 

в векторе

 

 

 

 

 

 

эксперессии

 

 

 

 

 

 

Неомицин-

Неомицин

Отбор клеток, устойчивых

Нельзя использовать для

 

 

 

фосфотрансфераза

 

к неомицину

промышленного получения белков

 

 

Металлотионин

Ионы кадмия

Отбор клеток, устойчивых

Только научные исследования

 

 

 

 

к наличию ионов кадмия

 

 

 

 

Дигидрофолат-

Тимидин и метотрексат

Отбор трансфицированных

Используется в промышленности

 

 

редуктаза (ДГФР)

(ингибиторы ДНФР)

клеток; об амплификации

 

 

 

 

 

 

судят по устойчивости

 

 

 

 

 

 

к метотрексату

 

 

213

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

методов

Биореакторы для культивирования животных клеток

ВВЕДЕНИЕ. За последние десятилетия разработаны

ча – создание системы, которая бы эффективно снаб-

биотехнологических

различные методы культивирования животных кле-

жала клетки кислородом, не разрушая их. Оптималь-

ток. Одной из самых сложных задач была оптимиза-

ное значение коэффициента массопередачи кислоро-

 

 

ция питательной среды. Некоторые белки, имеющие

да kLa для животных клеток составляет 2,2 в час (для

 

важное значение для медицины, могут быть получе-

микроорганизмов эта величина на 1–2 порядка боль-

 

ны в активной форме только в животных клетках.

ше). Разработано несколько способов «непрямого»

 

К таким белкам относятся человеческие антитела,

снабжения клеток газом, например с помощью полу-

 

фактор VIII, тканевой активатор плазминогена и др.

проницаемых мембран из силикона. Таким образом, в

 

Для их производства используют биореакторы объе-

реакторе объемом 1000 л с вращающейся мембраной

 

мом до 10 000 л. Как и в случае микробной фермен-

при давлении до 6 бар интенсивность снабжения кис-

 

тации, при культивировании животных клеток высо-

лородом достигает 120 г О2/(м3·ч). Цены на пита-

Основы

кие требования предъявляются к перемешиванию и

тельные среды для животных клеток очень высокие,

аэрации клеточной суспензии. Обычно белки, полу-

поэтому важно рационально использовать эти среды.

 

 

ченные в животных клетках, очень тщательно очища-

При непрерывном культивировании перфузионным

 

ют, избавляясь не только от примесей других белков,

способом клетки удерживаются в среде посредством

 

но и от следовых количеств ДНК или РНК (в особен-

мембранного фильтра с микропорами. При дости-

 

ности ретровирусной).

жении необходимой плотности клеток начинается пе-

 

ПИТАТЕЛЬНЫЕ СРЕДЫ. Наряду с интенсивным снаб-

реработка биопродукта в непрерывном режиме. Таким

 

жением клеток кислородом и CO2 для успешного

образом удается поддерживать систему в равновес-

 

культивирования животных клеток необходим пра-

ном состоянии (т. е. осуществлять культивирование и

 

вильно подобранный состав питательной среды.

производство продукта) на протяжении более 900 ч.

 

В качестве источника углерода обычно используют

Процесс образования продукта в клетках, иммобили-

 

глюкозу. В питательной среде должны присутство-

зованных на микрочастицах, также может быть весь-

 

вать также аминокислоты, витамины, белки, жирные

ма продолжительным (до 30 сут.). В современной

 

кислоты, неорганические соли и другие вещества,

промышленности метод непрерывного культивирова-

 

необходимые для роста клеток. Ранее в среды доба-

ния используется исключительно для суспендирован-

 

вляли сыворотку крови быка: в ней содержится боль-

ных клеток в масштабах до 10 000 л на средах, не со-

 

шое количество белков, необходимых для роста

держащих сыворотки.

 

культуры животных клеток, однако эта сыворотка

ОЧИСТКА ПРОДУКТА. В отличие от большинства про-

 

очень дорогая, при этом существует высокий риск за-

цессов микробной ферментации для очистки продукта

 

ражения культуры вирусами или бактериями. В сре-

животных клеток нет необходимости в разрушении

 

ды, не содержащие сыворотки, вносят трансферрин,

клеток, так как он секретируется в среду роста. В то

 

инсулин, сывороточный альбумин и липопротеины.

же время для продукта животных клеток требуется

 

Для поддержания постоянного уровня рН в среду

очень тщательная очистка, которая, кроме идентифи-

 

культивирования добавляют бикарбонаты или прово-

кации продукта (пептидное картирование, определе-

 

дят все операции в атмосфере СО2.

ние аминокислотной последовательности, масс-спек-

 

ЛАБОРАТОРНЫЕ МЕТОДЫ. В лабораторных условиях

трометрия MALDI-TOF, двумерный электрофорез

 

культивирование животных клеток проводят в рол-

белков) включает контроль отсутствия онкогенной и

 

лерных бутылях или специальных флаконах. Если

способной к трансформации ДНК животных клеток.

 

требуется больший объем (до 10 л), используют

В фармацевтическом препарате должна полностью от-

 

спиннерные емкости. В таких условиях удается дос-

сутствовать ретровирусная РНК, и может содержаться

 

тигнуть концентрации клеток 1–2 млн/мл.

не более 100 пикограмм (10–10 г) ДНК на дозу.

 

КЛЕТОЧНЫЙ РЕАКТОР. При переходе к биореакторам

 

 

необходимо помнить о том, что в ходе непрерывной и

 

 

периодической ферментации могут образовываться

 

 

токсичные вещества, ингибирующие синтез рекомби-

 

 

нантного продукта. В случае перфузионных культур

 

 

среду роста регулярно обменивают на свежую. Из со-

 

 

ображений безопасности (снижение риска распро-

 

 

странения инфекции) в промышленности, как прави-

 

 

ло, используют периодическую ферментацию.

 

 

Животные клетки в культуре очень чувствительны к

 

214

любым изменениям среды и механическим воздейст-

 

виям, поэтому возникает сложная инженерная зада-