Материал: Polioxialkanoaty_POA__biorazrushaemye_polimery_dlya_meditsiny

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

Таблица 2.1 – продолжение

55

56

Таблица 2.1 – окончание

57

Таблица 2.2

Возможные типы полиоксиалканоатов*

длина гидроксиалкановых кислот

 

C1

C2

C3

C4

C5

C6

C7

C8

C9

C10

C11

C12

C13

C14

C15

C16

C17

C18

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

1–OH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

2–OH

глико-

лактат

2HB

2HV

2HHx

2HHp

2HO

2HN

2HD

2HUD

2HDD

2HTriD

2HTD

2HPD

2HHxD

2HHpD

2HOD

лат

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3–OH

3HP

3HB

3HV

3HHx

3HHp

3HO

3HN

3HD

3HUD

3HDD

3HTriD

3HTD

3HPD

3HHxD

3HHpD

3HOD

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

4–OH

4HB

4HV

4HHx

4HHp

4HO

4HN

4HD

4HUD

4HDD

4HTriD

4HTD

4HPD

4HHxD

4HHpD

4HOD

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

5–OH

5HV

5HHx

5HHp

5HO

5HN

5HD

5HUD

5HDD

5HTriD

5HTD

5HPD

5HHxD

5HHpD

5HOD

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

6–OH

6HHx

6HHp

6HO

6HN

6HD

6HUD

6HDD

6HTriD

6HTD

6HPD

6HHxD

6HHpD

6HOD

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

7–OH

7HHp

7HO

7HN

7HD

7HUD

7HDD

7HTriD

7HTD

7HPD

7HHxD

7HHpD

7HOD

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

*Steibüchel, Valentin, 1995 b: выделены гидроксиалкановые кислоты, которые постоянно определяются как элементы ПОА биосинтеза (остальные – не всегда). Кислоты: HB – оксимасляная, HV – оксивалериановая, HHX – оксигексановая, HHP – оксигептановая,

HO – гидроксиоктановая, HN – гидроксинонановая, HD – гидроксидекановая, HUD – гидроксиундекановая, HDD – гидроксидодекановая, HtriD – гидрокситридекановая, HTD – гидрокситетрадекановая, HPD – гидроксипентановая, HHxD – гидроксигексадекановая,

HHpD – гидроксигептадекановая, HOD – гидроксиоктадекановая. HASCL, HAMCL, HALCL, соответственно, коротко – , средне – и длинноцепочечные ПОА.

В целом, исходя из длины углеродной цепи оксикислот, образующих полимеры, полиоксиалканоаты подразделяют на три основные группы (таблица 2.2):

1)короткоцепочечные (short-chain-length, SCL), состоящие из кислот с длиной углеродной цепи от 3-х до 5-ти углеродных атомов;

2)среднецепочечные (medium-chain-length, MCL), в составе которых от 6 до 14 атомов углерода;

3)длинноцепочечные (long-chain-length, LCL) с содержанием ки-

слот С17 и С18.

Данное разделение полимеров на группы базируется на существующем представлении о субстратной специфичности ПОАсинтаз, акцептирующих определенные оксикислоты при строительстве полимерной цепи в процессе полимеризации (Anderson, Dawes, 1990). Ранее считалось, что ПОА синтаза A. eutrophus и других природных штаммов способна полимеризовать оксикислоты, состоящие из 3–5 углеродных атомов, но не взаимодействует с оксикислотами с длиной углеродной цепи 6 и более. Поэтому представлялось невозможным получение коротко- и среднецепочечных ПОА природными штаммами Alcaligenes. Однако к настоящему моменту подтверждена более широкая субстратная специфичность PHA-синтез у природных штаммов, включая Ectothiorhodospira shaposhnikovii (Chen et al., 2001), Ralstonia eutropha (Волова со соавт., 1998; Grenn et al., 2002) и

продемонстрирована способность данных организмов к одновременному синтезу коротко- и среднецепочечных ПОА.

Синтазы из различных штаммов P. oleovorans, обладающие более широкой субстратной специфичностью, акцептируют оксикислоты, содержащие от 6 до 14 атомов углерода, поэтому способны синтезировать разнообразные, как средне-, так и длинноцепочечные ПОА (Doi, 1990; Steinbüchel, 1991; 2001; Byron, 1992, Steinbüchel, Valentin, 1995).

Последовательность реакций синтеза полиоксиалканоатов иллюстрирует схема (рис. 2.1). Процесс можно подразделить на три этапа: на первом происходит транспорт источника углерода, необходимого для синтеза полимеров, из внешней среды в клетку, который катализируется специфическими ферментными транспортными системами, локализованными в цитоплазматической мембране или расположенными диффузно внутри клетки. Вторая фаза, включающая комплекс анаболических и катаболических реакций, конвертирует компоненты в гидроксиацил коэнзим-А, тиоэфир которого является субстратом для ПОА-синтазы. На третьем этапе, ПОА синтаза (ключевой фермент биосинтеза данных полимеров), использует тиоэфиры как субстраты и катализирует образование эфирных связей между ними при участии КоА. Данное представление не допускает, что ПОА синтаза для образования полимеров также использует другие

58

Рис. 2.1. Этапы синтеза ПОА в бактериях (Steinbüchel, Valentin, 1995b).

тиоэфиры гидроксикислот. Вторая фаза – очень существенна для процесса в целом, т. к. во время нее источник углерода конвертируется в субстраты, необходимые для синтеза ПОА. Многие бактерии способны превращать КоА последовательно в ацетацетил КоА и далее – в D(-)-3-гидроксибутирил-КоА, дающий начало полиоксибути-

рату (Anderson, Dawes, 1990).

Охарактеризованные к настоящему моменту типы ПОА теоретически могут дать возможность для получения нескольких миллионов вариантов полимеров. Комбинирование генов систем биосинтеза коротко-, средне- и длинноцепочечных ПОА и варьирование условий выращивания микроорганизмов уже сейчас позволяет получать полиоксиалканоаты разнообразнейших структур: полиоксибутират, полиоксивалерат, полиоксигексаноат, полиоксиоктаноат и двух-, трех- и четырехкомпонентные смеси с различным набором и соотношением гидроксибутирата и гидроксивалерата, гидроксигексаноата и гидроксиоктаноата

(Tim et al., 1992; Steinbüchel, Valentin, 1995b; Braunegg et al., 1998).

2.3. Биохимические пути синтеза полиоксиалканоатов

Полиоксиалканоаты синтезируются в ходе сложного многоступенчатого биосинтетического процесса, каждую стадию которого катализируют специфические ферменты. Знание закономерностей структурно-функциональной организации внутриклеточного цикла ПОА дает возможности управления этим процессом и основу для синтеза полимеров с новыми свойствами.

На примере наиболее изученного из полиоксиалканоатов – полимера β-оксимасляной кислоты, установлено, что пути его синтеза

59