Материал: Резников В.А., Штейнгарц В.Д. Аминокислоты PDF

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

O

H2N CH C OH

CH2

N

NH

hƒK!=……/å ãë="/ ,ƒ *3!“= œn!ã=…,÷å“*= .,ì, B

АМИНОКИСЛОТЫ

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

H2N

 

 

CH

 

 

C

 

OH

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

H2N

 

 

CH

 

 

C

 

OH

 

 

 

CH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

HN

OH

lhmhqŠepqŠbn nap`gnb`mh“ pnqqhiqjni tedep`0hh

НОВОСИБИРСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ ФАКУЛЬТЕТ ЕСТЕСТВЕННЫХ НАУК

hƒK!=……/å ãë="/ ,ƒ *3!ñ= œn!ã=…,÷åñ*=ÿ .,ì,ÿB

`ì,…%*,ñë%2/

Пособие для студентов специализаций “ХИМИЯ” и “ЭКОЛОГИЯ”

III и IV семестры

Новосибирск

1999

Составители:

Проф. В. А. Резников Проф. В. Д. Штейнгарц

Рецензент канд. хим. наук К. Ю. Колтунов

Пособие представляет собой часть курса лекций “Органическая химия”, читаемого студентам второго курса специализаций “химия” и “экология”, рекомендуется также студентам отделения “биология и медбиология” и другим студентам, изучающим органическую химию.

Новосибирский государственный университет, 1999

2

СОДЕРЖАНИЕ

α-Аминокислоты

4

Синтез алифатических аминокислот. Синтез α-аминокислот

7

Синтез других алифатических аминокислот

16

Свойства аминокислот.

 

Стереохимия

21

Кислотно-основные свойства

22

Реакции аминокислот

25

Реакции аминокислот in vivo

30

Ароматические аминокислоты

34

Пептиды и белки

38

Синтез пептидов

39

Анализ пептидов

46

Пространственное строение белков

49

АМИНОКИСЛОТЫ

Аминокислоты, как видно из названия, – это любые органические кислоты, в состав молекулы которых входит аминогруппа, хотя чаще всего под этим названием подразумевают α-аминокислоты вследствие их исключительного значения как составляющей части биополимеров – белков. Белки имеют очень важное и разнообразное значение в функционировании живого организма – они являются питательными веществами, регулируют обмен веществ, являются основой мышечной ткани, участвуют в передаче генетической информации и т. д.

α-Аминокислоты

В природе встречается более 70 аминокислот, почти все они за исключением пролина и оксипролина имеют структуру типа RCH(NH2)CO2H. Структурные формулы и названия наиболее распространенных α-аминокислот приведены в таблице.

Название

Структурная

Изоэлек-

 

Название

Структурная

Изоэлек-

(сокращение)

формула

трическая

 

(сокращение)

формула

трическая

 

 

 

точка (pI)

 

 

 

 

точка (pI)

Глицин (gly)

H2NCH2CO2H

5,97

 

Лейцин (leu)

H C

CO2H

5,98

 

 

 

 

 

 

3

 

 

 

 

 

 

 

 

CH3 NH2

 

Аланин (ala)

H3C

CO2H

6,02

 

Изолейцин (ile)

H3C

CH3

6,02

 

 

NH2

 

 

 

CO H

 

 

 

 

 

 

 

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

Валин (val)

H3C

CO2H

5,97

 

Пролин (pro)

 

 

6,10

 

H3C

 

 

 

N

CO2H

 

 

 

NH2

 

 

 

H

 

 

3

Название

Структурная

Изоэлек-

 

Название

 

Структурная

 

Изоэлек-

(сокращение)

формула

 

трическая

 

(сокращение)

формула

 

 

трическая

 

 

 

 

точка (pI)

 

 

 

 

 

 

точка (pI)

Оксипролин

HO

 

 

5,78

 

Метионин (met)

H3CSH2CH2C

CO2H

5,75

(hypro)

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

N

 

CO2H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Фенилаланин

H

 

 

5,88

 

Аспарагиновая

 

 

 

2,87

PhH2C

 

CO2H

 

HO2CCH2C

CO2H

(phe)

 

NH2

 

 

кислота (asp)

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Триптофан

 

 

CO

5,88

 

Аспарагин

 

O

 

 

5,41

(try)

 

 

NH2

 

 

(asp(NH2))

 

H2NCCH2C

CO2H

 

 

 

N

 

 

 

 

 

NH2

 

 

 

 

H

 

 

 

 

 

 

 

 

Глутаминовая

 

 

3,22

 

Гистидин (his)

 

 

 

7,58

HO2C

 

CO2H

 

N

NH2

 

кислота(glu)

 

 

NH2

 

 

 

 

N

CO2H

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Глутамин

 

 

 

5,65

 

Серин (ser)

 

H

 

 

5,68

O

 

CO2H

 

 

HOH2C

CO2H

 

(gluNH2)

C

 

 

 

 

 

NH2

 

 

 

H2N

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Лизин (lys)

HO2C

(CH2)4-NH2

9,74

 

Треонин (thr)

OH

CO2H

 

6,53

 

NH2

 

 

 

 

 

H3C

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NH2

 

 

Аргинин

HO2C

(CH2)4-NH

N10,76

 

Тирозин (tyr)

 

 

CO2

5,65

(arg)

 

 

 

 

 

NH2

 

 

NH2

 

 

 

 

 

HO

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Цистеин

HSH2C

 

CO2H

5,02

 

Цистин

(cyS-

2(-SH2C

CO2H

 

5,06

(cysH)

 

NH2

 

 

Scy)

 

NH2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Незаменимыми называются α-аминокислоты, которые не могут быть синтезированы организмом из веществ, поступающих с пищей в количествах, необходимых для поддержания жизнедеятельности. К незаменимым для человека аминокислотам относятся лейцин, изолейцин, лизин, метионин, фенилаланин, треонин, триптофан и валин. Кроме того, бывают заболевания, при которых организм не способен вырабатывать еще какие-либо аминокислоты, в результате чего они становятся индивидуально незаменимыми. Примером является фенилкетонурия – генетическое заболевание, приводящее, в частности, к нарушению умственной деятельности и связанное с нарушением обмена веществ. Люди, страдающие этим заболеванием, нуждаются в тирозине, который не вырабатывается их организмом.

СИНТЕЗ АЛИФАТИЧЕСКИХ АМИНОКИСЛОТ

Синтез α-аминокислот

Почти все природные α-аминокислоты имеют в составе молекулы асимметрический атом углерода, связанный с аминогруппой. Учитывая, что в их синтезе участвуют ферменты – сложные оптически активные органические соединения, природные аминокислоты также являются оптически активными и относятся к L-ряду. Более того, организм может оперировать только тем оптическим изомером, который ему характерен, противоположный энантиомер в обмене веществ не участвует. Учитывая сложность синтеза оптически активных соединений in vitro (“в пробирке”), в лабораторных условиях и вообще

4

химическим путем синтезируют рацемические аминокислоты, которые далее могут быть разделены на энантиомеры уже известными вам методами. Сначала мы рассмотрим именно эти методы синтеза.

В качестве исходных соединений в синтезе α-аминокислот могут быть использованы α- галоидкарбоновые кислоты, синтез которых проводят по методу Гелля-Фольгарда-Зелинского действием брома в присутствии красного фосфора или каталитического количества пиридина на карбоновые кислоты. При взаимодействии α-бромкарбоновых кислот с избытком аммиака образуются соответствующие аминокислоты.

 

 

 

NH3

R

RCH2CO2H + Br2

P

RCHBrCO2H

CO H

 

2

 

 

 

 

NH2

Почему в синтезе α-аминокислот из галоидкарбоновых кислот необходимо использовать

избыток аммиака? К какому типу относится эта реакция, какие побочные продукты могут в ней образовываться?

Как вы помните, аммонолиз алкилгалогенидов является не лучшим методом синтеза аминов. Для селективного синтеза первичных аминов предпочтительным является метод Габриэля, заключающийся во взаимодействии алкилгалогенидов c фталимидом калия и последующем гидролизе фталимидного производного. Этот метод неприменим к галоидкарбоновым кислотам (почему?), однако в реакцию можно вводить α-галоидзамещенные эфиры карбоновых кислот или галоидзамещенные малоновые эфиры.

 

 

O

 

 

O

 

R

NH3+ Cl-

 

 

 

-

K

+

R

HCl / H2O

HO C

 

Br

 

N

 

N

 

2

 

 

CO2Et

+

 

 

CO2Et

 

хлоргидрат

α-

 

 

 

 

R

O

 

 

O

 

 

 

 

 

аминокислоты

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Броммалоновые эфиры получают бромированием малоновых эфиров бромом в неполярном органическом растворителе. При взаимодействии броммалонового эфира с фталимидом калия образуется фталимидное производное. При этом один из “кислых” атомов водорода малонового эфира остается незамещенным, и, следовательно, полученное фталимидное производное является СН-кислотой, которая образует анион при действии сильного основания, например этилата натрия. Алкилирование этого аниона приводит к замещенному малоновому эфиру А, кислотный гидролиз которого затрагивает как фталимидную, так и обе сложноэфирные группы, и завершается образованием аминодикислоты. Являясь производным малоновой кислоты, это соединение легко декарбоксилируется при нагревании с образованием аминокислоты в виде хлоргидрата.

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

O

 

 

 

CO2Et

 

 

 

CO2Et

 

-

K

+

 

 

 

CO2E

 

 

 

 

 

 

Br2

Br

 

 

+

N

 

 

 

 

N

OEt-

 

 

CO

Et

 

 

CO

Et

 

 

 

 

 

 

CO2E

 

 

2

 

 

CCl4

 

2

 

 

O

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

O

 

 

 

 

 

O

R

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

CO2Et

RBr

 

 

 

 

H O+

HO C R

 

t

 

R

 

 

N

-

 

N

CO Et

 

 

 

 

+

 

 

 

 

 

 

2

 

 

3

2

NH

+

 

 

NH3

 

 

CO

Et

 

 

CO2Et

 

 

t

HO

C

 

 

 

 

 

 

 

 

HO2C

 

3

 

 

O

 

2

 

 

O

 

 

 

 

 

 

2

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

А

При использовании броммалонового эфира может быть синтезирован фенилаланин с выходом 60%. Напишите последовательность необходимых для этого реакций. Предложите механизм каждой из стадий реакции.

5