Секвенирование геномов de novo
4) Рэндом-секвенирование или шотган-метод (shotgun) и сборка ДНК
Геномика и протеомика
Сборка геномов с использованием референсного
Геномика и протеомика
Секвенирование ДНК следующих поколений (NGS)
Полногеномное секвенирование. |
(next generation sequencing) |
Общая схема:
приготовление библиотеки (дробление ДНК и лигирование адаптеров)
амплификация
индивидуальных фрагментов и отжиг праймеров
синтез цепи, комплементарной регистрация сигнала
секвенируемому фрагменту
интеграция сигнала, перевод в последовательность ДНК
(basecalling)
Геномика и протеомика
Секвенирование ДНК следующих поколений
Основные области применения:
1.Фундаментальные исследования
2.Секвенирование геномов человека - прогнозирование
3.Диагностика инфекционных болезней
4.Ретроспективный эпиданализ
5.Медицинская генетика
6.Пренатальная диагностика
7.Фармакогеномика и устранение побочных эффектов
8.Трансплантология
9.Биобезопасность
10.Контроль качества продуктов питания
11.Метагеномика
12.Селекционная работа
13.ДНК-генеалогия
14.Этногеномика
15.Палеогеномика
16.Идентификация человека по ДНК: определение отцовства, геномная дактилоскопия
17.Образование
Геномика и протеомика
Секвенирование ДНК следующих поколений (NGS)
Полногеномное секвенирование сегодня: Основные технологии:
Геномика и протеомика