Материал: 03-20-GP-SequencingHumanGenome

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

Геномика и протеомика

Модуль 1. Клонирование, идентификация и анализ ДНК

Лекция 3. Секвенирование ДНК. Геном человека

1.3.1. Химическая структура ДНК (повторение)

1.3.2. Секвенирование ДНК: I поколение методов

1.3.3. Автоматизация секвенирования ДНК

1.3.4. Секвенирование ДНК следующих поколений (NGS)

1.3.5. Стратегия секвенирования целых геномов

1.3.6. Первый секвенатор NGS: пиросеквенирование 454

1.3.7. Флуоресцентное секвенирование Illumina

1.3.8. Международный проект «Геном человека»

Химическая структура ДНК и РНК

Пурины

Пиримидины

Генетическая информация записана в виде последовательности нуклеотидных остатков, которые содержат одно из 4-х азатистых оснований: аденина (A), цитозина (C), гуанина (G) и тимина (T). У некоторых фагов Т замещен урацилом (U - фаг PBS1), который обычно входит в состав РНК.

Химическая структура ДНК и РНК

Нуклеотид — основная структурная единица нуклеиновых кислот, их мономерное звено. Состоит из фосфата, сахара дезоксирибозы (ДНК) или рибозы (РНК) и одного из азотистых оснований. Последовательность оснований содержит генетическую информацию, а остатки моносахаридов и фосфорной кислоты играют структурную роль (носители, оснований). ДНК состоит из дезоксирибонуклеотидов.

Химическая структура ДНК и РНК

Нуклеозид — При частичном гидролизе нуклеотидов отщепляется остаток фосфорной кислоты и образуются нуклеозиды, молекулы которых состоят из остатка пуринового или пиримидинового основания, связанного с остатком моносахарида — рибозы или дезоксирибозы.

Структурная формула пуринового нуклеозида

Химическая структура ДНК и РНК

Структурная формула цепи ДНК

В молекулах ДНК и РНК отдельные нуклеотиды связаны в единую полимерную цепь за счет образования сложноэфирных связей между остатками фосфорной кислоты и гидроксильными группами при 3- м и 5-м атомах углерода моносахарида.

Длина цепи ДНК – 1-2 м для млекопитающих

<1 млн для большинства бактерий

5 млн для E.coli

3 биллиона для человека и мыши