Статья: Валидация способа определения концентрации 146S иммуногенного компонента вируса ящура в вакцине при сравнении графиков второй производной для сигмоид реакции амплификации

Внимание! Если размещение файла нарушает Ваши авторские права, то обязательно сообщите нам

Таблица 1

Оценка специфичности методики опосредованного определения концентрации 146S компонента вируса ящура в сырье для вакцины при сравнении графиков второй производной для кривых ОТ-ПЦР-РВ (n = 5, M±m)

№ смеси

Состав модельной смеси

Относительная погрешность (e) при измерении концентрации 146S частиц в сырье для вакцины методом ОТ-ПЦР-РВ, %

название компонента

содержание компонента в смеси, %

концентрация 146S компонента, мкг/см3

1

146S

100

5,00

0,20-0,65

75S+12S+3,8S

0

2

146S

80

4,00

0,25-1,50

75S+12S+3,8S

20

3

146S

60

3,00

0,35-1,67

75S+12S+3,8S

40

4

146S

40

2,00

0,50-2,00

75S+12S+3,8S

60

5

146S

20

1,00

1,00-2,00

75S+12S+3,8S

80

6

146S

10

0,50

2,00-3,12

75S+12S+3,8S

90

7

146S

2

0,10

3,00-3,54

75S+12S+3,8S

98

8

146S

1

0,05

4,00-5,00

75S+12S+3,8S

99

9

146S

0,5

0,025

-*

75S+12S+3,8S

99,5

Примечание: * Cp превышают предельное значение, позволяющее применять функцию C,46S ВЯ = 0,0111(С )2-l,0157C +20,446.

Из данных таблицы 1 видно, что относительная погрешность опосредованного определения концентрации 146S компонента вируса ящура с помощью валидируемой методики при содержании 146S частиц 5,00-4,00; 4,00-3,00; 3,00-2,00; 2,00-1,00; 1,00-0,50; 0,50-,10; 0,10-0,05 мкг/см3 составляла 0,20-1,50; 0,25-1,67; 0,35-2,00; 0,50-2,00; 1,00-3,12; 2,00-3,54; 3,00 - 5,00%, соответственно. Таким образом, отмечали высокую специфичность методики для суспензий с концентрациями 146S частиц вируса ящура от 5,00 до 0,05 мкг/см3, при исследовании которых относительная погрешность не превышала 5%. В исследовании не анализировали пробы с концентрациями 146S компонента более 5,00 мкг/см3, поскольку в неинактивированных суспензиях культурального вируса ящура содержание не превышает данного значения.

Следующий этап исследования посвящен оценке правильности валидируемой методики, тестируя в ОТ-ПЦР-РВ 350 проб вируса ящура с концентрациями 146S компонента: 0,10; 0,50; 1,00; 2,00; 3,00; 4,00; 5,00 мкг/см3 (по 50 проб на каждую концентрацию). Результаты исследования представлены на рисунке 1 в виде линейной функции y = 0,9963-x+0,0149, которая при степени достоверности (R2) 0,9994, подтверждает, что тангенс угла наклона (k) стремится к единице (k = 0,9963), а свободный член (b) - к нулю (b = 0,0149). Таким образом, применение валидируемой методики позволяет получать достоверные результаты.

На следующем этапе проводили оценку прецизионности методики опосредованного определения концентрации 146S частиц вируса ящура в сырье для вакцины при сравнении графиков второй производной для кривых ОТ-ПЦР-РВ с расчетом абсолютных и относительных показателей вариации.

Прецизионность в условиях сходимости определяли по вариабельности результатов реакции внутри одного исследования 5 суспензий культурального вируса ящура с концентрациями 146S компонента: 0,10; 1,00; 2,00; 3,00; 5,00 мкг/см3, которые одновременно тестировал один оператор на одном анализирующем термоциклере в 20 повторениях. Результаты статистического анализа полученной совокупности максимальных экстремумов сигмоидных ОТ-ПЦР-РВ (Cp. отражены в таблице 2, из данных которой следует, что размах вариации составил 0,040,29, среднее линейное отклонение - 0,0080,045, иными словами, уровень вариации Cpj в полученных выборках при указанных значениях концентрации 146S частиц вируса ящура относительно средней величины признака низкий. Коэффициент дисперсии находился в диапазоне 0,000-0,004, среднее квадратичное отклонение составило 0,0110,063, что подтверждает незначительную степень отклонений индивидуальных значений Cp от среднего арифметического (Срср). Таким образом, колеблемость индивидуальных значений в выборках низкая, а значения Cp представляют собой надежную совокупность.

Для оценки колеблемости полученных значений Cpj внутри генеральной совокупности определяли относительные показатели вариации. Коэффициент осцилляции составлял 0,208-0,981%, иными словами, относительное изменение крайних значений Cpj по сравнению со средней величиной во всех выборках низкое. Линейный коэффициент вариации находился в диапазоне 0,044-0,152%, следовательно, доля усредненного значения отклонений от Срср в каждой совокупности не значительна. Коэффициент вариации индивидуальных значений пороговых циклов амплификации составил 0,056-0,214%, что соответствует общим требованиям, предъявляемым к валидируемым методикам (Cg<2%) [3, 4, 5, 10].

Таким образом, при исследовании суспензий вируса ящура с концентрациями аналита от 0,10 до 4,00 мкг/см3 в 20 повторениях с помощью предложенной методики одним оператором получены однородные и надежные совокупности значений максимальных экстремумов графиков второй производной сигмоид ОТ-ПЦР-РВ, которые можно применять для опосредованного выражения концентрации 146S компонента вируса ящура.

Следующий этап работы был посвящен исследованию прецизионности валидируемой методики в условиях воспроизводимости. Для этого анализ суспензий культурального вируса ящура проводили два оператора в разное время в 20 повторениях (40 измерений для каждой пробы). Полученные результаты отражены в таблице 2, из которой следует, что для генеральной совокупности значений Cp размах вариации составил 0,07-0,66, среднее линейное отклонение (d) - 0,009-0,055, иными словами, степень колеблемости Cpt в полученных выборках относительно среднего уровня признака низкая. Дисперсия составила 0,000-0,008, среднее квадратичное отклонение - 0,012-0,091, что подтверждает незначительную степень отклонений индивидуальных значений Cp от среднего арифметического и высокий уровень достоверности результатов внутри каждой выборки максимальных экстремумов графика второй производной сигмоиды ОТ-ПЦР-РВ.

Рис. 1. Исследование правильности методики опосредованного определения концентрации 146S компонента вируса ящура при сравнении графиков второй производной для кривых ОТ-ПЦР-РВ (n = 5)

Исследуя относительные показатели вариации Cpp выявили, что коэффициент осцилляции составил 0,365-2,231%, линейный коэффициент вариации - 0,045-0,185%, коэффициент вариации - 0,064-0,185%, что соответствует общепринятым нормам (C5<3%) [3]. Исходя из полученных результатов, относительное изменение крайних значений Cp и доля усредненного значения абсолютных отклонений в сравнении со средним внутри каждой совокупности незначительна. Следует отметить, что вариация значений параметров валидации при исследовании суспензий вируса ящура с увеличением концентрации 146S компонента от 0,10 до 5,00 мкг/см3 снижалась, а степень достоверности результатов возрастала.

В результате сравнительного анализа данных, полученных при оценке прецизионности валидируемой методики, доказали, что в условиях сходимости степень достоверности результатов опосредованного определения концентрации 146S частиц вируса ящура выше по сравнению с оценкой, проводимой в условиях воспроизводимости, что соответствует общепринятым статистическим ожиданиям [9]. По абсолютным и относительным показателям вариации валидируемая методика удовлетворяла критериям приемлемости [3, 9, 11].

На следующем этапе исследования определяли предел обнаружения (POC146S) и количественного определения (ПКОС1463) концентрации 146S компонента вируса ящура в сырье для вакцины с помощью валиди- руемой методики. Проведя исследования в 7 повторениях, получили следующие значения свободного члена (b): 20,444; 20,446; 20,447; 20,448; 20,449; 20,443; 20,446. Учитывая, что стандартное отклонение свободного члена (Sb) составило 0,002, а тангенс угла наклона (k) был равен (-0,45), провели расчеты и определили, что nOc146S данной методикой составил 0,01551 мкг/см3 (или 15,51 нг/см3), а nKOC146S - 0,047 мкг/см3 (или 47 мкг/см3).

Таблица 2

Оценка прецизионности методики для опосредованного определения концентрации 146S частиц вируса ящура при сравнении графиков второй производной для кривых ОТ-ПЦР-РВ (n = 5)

Валидационные показатели методики при оценке прецизионности

Значения показателей валидации при исследовании суспензий с разными концентрациями 146S частиц вируса ящура (мкг/см3)

условия сходимости

условия воспроизводимости

0,10

1,00

2,00

3,00

5,00

0,10

1,00

2,00

3,00

5,00

объем выборки Cp (N)

20

20

20

20

20

40

40

40

40

40

среднее значение Cp (СРср)

29,569

27,078

24,811

22,811

19,198

29,579

27,066

24,802

22,779

19,197

суммарное значение индивидуального линейного отклонения по модулю (X|di|)

0,896

0,844

0,630

0,354

0,168

2,192

2,424

1,932

1,818

0,342

суммарное значение квадрата модуля индивидуального линейного отклонения (Xdi2)

0,080

0,054

0,042

0,010

0,002

0,329

0,226

0,197

0,154

0,006

наибольшее значение Cp (Cp )

29,640

27,200

24,900

22,860

19,220

29,950

27,300

24,960

22,860

19,230

наименьшее значение Cp (Cpmin)

29,350

27,000

24,690

22,770

19,180

29,290

26,980

24,650

22,600

19,160

размах вариации (R)

0,290

0,200

0,210

0,090

0,040

0,660

0,320

0,310

0,260

0,070

среднее линейное отклонение (dm)

0,045

0,042

0,031

0,018

0,008

0,055

0,061

0,048

0,045

0,009

дисперсия (52)

0,004

0,003

0,002

0,001

0,000

0,008

0,006

0,005

0,004

0,000

среднее квадратичное отклонение (5)

0,063

0,052

0,046

0,023

0,011

0,091

0,075

0,070

0,062

0,012

коэффициент осцилляции (VR), %

0,981

0,739

0,846

0,395

0,208

2,231

1,182

1,250

1,141

0,365

линейный коэффициент вариации (Cd), %

0,152

0,156

0,127

0,078

0,044

0,185

0,224

0,195

0,199

0,045

коэффициент вариации (C5), %

0,214

0,191

0,185

0,099

0,056

0,306

0,278

0,283

0,272

0,064

Рассчитанное значение nKOC146S подтверждали экспериментально при исследовании 5 модельных образцов культурального вируса ящура с концентрациями 146S компонента: 0,015; 0,030; 0,045; 0,050; 0,100 мкг/см3 в пяти повторениях. Результаты анализа отражены в таблице 3.

Таблица 3

Выявление предела количественного опосредованного определения концентрации 146S компонента вируса ящура при сравнении графиков второй производной для кривых ОТ-ПЦР-РВ (n = 5, M±m)

№ суспензии вируса ящура

Концентрация 146S частиц (C146S), мкг/см3

Исследование суспензии в ОТ-ПЦР-РВ

Экспериментальное подтверждение, что теоретическое значение ПКО - 0,047 мкг/см3, 146S

Cp

концентрация 146S частиц (C146S), мкг/см3

1

0,015

31,56

-*

подтверждено

2

0,030

30,49

-

подтверждено

3

0,045

30,14

-

подтверждено

4

0,050

29,52

0,048

подтверждено

5

0,100

29,38

0,100

подтверждено

Примечание: «-» - концентрация 146S частиц не определена, так как значение максимального экстремума графика второй производной сигмоиды ОТ-ПЦР-РВ выходит за пределы функции C146S ВЯ = 0,0111(Cp)2-1,0157Cp+20,446.

Из данных таблицы 3 следует, что экспериментальное значение nKOC146S валиди- руемой методикой подтверждает расчеты и составляет 0,050 мкг/см3.

При исследовании 8 модельных образцов с концентрациями 146S компонента вируса ящура: 0,05; 0,50; 2,00; 5,00; 10,00; 14,00; 14,75; 15,00 мкг/см3 определили, что аналитическая область опосредованной оценки содержания 146S частиц при сравнении графиков второй производной для кривых ОТ-ПЦР-РВ находилась в диапазоне 0,05