Материал: Павлинов И.Я. Таксономическая номенклатура. Книга 3. Современные кодексы

инфраподвидовыхтаксоновиихназваний: они не имеют официального статуса, но правила обращения с ними такие же, как и в случае регламентированных категорий.

Примечание. Впоследнеевремяобсуждаютсянекоторыеправиланоменклатурыдляцианобактерий, которые в прежних классификациях фигурировали как «сине-зелёные водоросли»

(Komárek, Golubić, 2004; Oren, 2004).

2.4. ВИРУСОЛОГИЧЕСКАЯ НОМЕНКЛАТУРА

Как указано в предыдущем разделе, номенклатура вирусов первоначально рассматривалась в рамках «Бактериологического кодекса». Онаобособляетсяотбактериологическойноменклатуры вслед за учреждением Международного комитета по систематике вирусов (ICTV) в 1971 г. и оформляется в свод принципов и правил, названныйпервоначально«Правиланоменклатурывирусов», позже«Международный кодекс систематики и номенклатуры вирусов». Онпретерпеваетнесколькоревизованныхизда-

ний(1980, 1998, 2002, 2012 гг.), которыеготовит ииздаётназванныйКомитетподэгидойСектора вирусологии при Международном союзе микробиологических обществ (Mayo, Horzinek, 1998; The International Code…, 2013). В насто-

ящее время действует его версия, введённая в

2012 г. (The International Code…, 2013). Русско-

язычное (неполное) изложение предыдущего издания Кодекса доступно в Википедии.

Данный Кодекс примечателен тем, что он официально регулирует правила и систематизации, и именования вирусов, обеспечивая тесную взаимосвязь этих двух «оснований» систематики. Он самый короткий и просто организованныйсредисовременныхноменклатурных сводов в биологической систематике, разделён на три основных раздела.

Раздел I «Статусная основа Международного комитета по систематике вирусов» оп-

ределяет общие цели этого комитета, включая разработкумеждународнопризнанныха) классификаций, б) правилобразованияиизменения названий, в) самих названий и г) указателя названий.

Раздел II «Принципы» аналогичен Пре-

амбуледругихкодексов, включаетпятьпунктов соследующимиосновнымипозициями: 1) стабильность номенклатуры как сверхценность, 2) независимость от прочих кодексов, 3) номиналистический статус названий (обозначают, а не описывают), 4) типификация как основной

способ определения таксонов, 5) признание официальногостатусаназваниятаксонатолько после подтверждения ICTV.

Раздел III «Правила классификации и номенклатуры» включает девять подразделов с правилами разработки классификации

иноменклатуры (в узком смысле) вирусов. Многие из этих правил снабжены обширными пояснениями.

Подраздел I «Общие правила» утверждает международный универсальный характер правил и разрабатываемых на их основе классификаций и названий, приводит перечень регулируемых данным Кодексом ранговых категорий (отряд, семейство, подсемейство, род, вид), исключает из регулирования внутривидовые единицы и лабораторные линии. Специально оговаривается, что для признания таксонавалиднымонвопубликованнойработе должен быть охарактеризован отличающими признаками и отнесён к одной из признанных Кодексом ранговых категорий.

Подраздел II «Правила для именования та-

ксонов» вводит две основных категории названий. Валидное название должно отвечать требованиям настоящего Кодекса и обозначать таксон. Названиестановитсяпризнаннымпосле еговключениявофициальныймеждународный Указатель названий. Стабильность названий обеспечивается принципом используемости, нонеприоритета. Рядправилкасаетсялингвистических норм (включая запрет на эпонимы и омонимы). Все изменения в классификации и именовании вирусов, а также неясные случаи (синонимика и т.п.) подлежат рассмотрению

иутверждению Исполнительным комитетом

ICTV

Подразделы III–VII включают правила для именования таксонов каждой из признанных ранговыхкатегорий. Длявидовопределено, что егоназваниедолжновключатьколичествослов, достаточноедляпрактическихцелей(принцип биномиальностинеобязателен), иможетвключать цифры и символы (если это закреплено практикой). Для надвидовых таксонов определены рангоспецифичные окончания названий родов, подсемейств, семейств и отрядов.

Подраздел VIII «Правила для субвирусных агентов» определяет, чтоутверждённыеКодексом правила применимы для классификации и обозначениявироидов, ссоответствующеймодификацией рангоспецифичных окончаний их названий(-viroi… вместо-vir…). Аналогичным

образом трактуются ретротранспозоны, но не сателлиты и прионы.

ПодразделIХ«Правилаорфографии» содер-

житнормативыдлянаписаниятаксономических названий, подпадающих под действие данного Кодекса.

2.5. БИОЛОГИЧЕСКАЯ НОМЕНКЛАТУРА

Таксономическаяноменклатура, предназначенная для обозначения почти всех основных групп организмов без их деления по предметному принципу (вирусы не включены), оформлена как «Биокодекс». Инициатор и наиболее активный участник его разработки

– английский миколог Дэвид Хоуксворт. Его усилиями на XXV Генеральной ассамблее МСБН(Париж, 1994 г.) учреждаетсяМеждународныйкомитетпобиономенклатуре, который разрабатывает первый проект «Биокодекса». Еготретьяредакцияпубликуетсявнескольких печатных изданиях и затем в Интернете (1996 г.). Согласноэтомупроекту«Биокодекс» предполагалосьввестивдействиев2000 г. (Greuter et al., 1996; Проектбиокодекса…, 1997). Однако на собрании членов Международного комитета по биономенклатуре во время очередной ГенеральнойассамблеиМСБН (Неаполь, 2001 г.) было решено серьёзно доработать «Биокодекс», что вылилось в подготовку проекта его следующей версии, опубликованной в 2011 г. (Greuter et al., 2011). Нарусскомязыкедоступен перевододнойизпредыдущихверсий(Проект Биокодекса…, 1997).

Организация «Биокодекса», как и он сам, вполне традиционна: включает Преамбулу и триосновныхраздела: Принципы, Правила, Авторизация. Ондостаточнолаконичен, очёмсвидетельствует не слишком большое количество статей: ихвсего35. Вотличиеотзоологического

иботанического кодексов, в рассматриваемом нет ни приложений, касающихся грамматики

иорфографии таксономических названий, ни словаря терминов. Этот последний выпущен отдельным изданием, включающим также тер-

мины синтаксономии (Hawksworth, 2010).

Преамбула, послестандартнойдекларации о необходимости универсальной стабильной номенклатуры, указывает сферу влияния данного Кодекса (все таксоны современных и ископаемых эу- и прокариотных организмов,

атакже ихнотаксоны); признаёт актуальность действующих предметных кодексов бактериологической, ботанической и зоологической

номенклатуры (в «Биокодексе» они названы «специальными») в отношении регулирования названий, не включённых в «Принятые (Adopted) списки защищённых названий»; не признаёт названия, регулируемые фило- и вирусологическим кодексами; не принимает во вниманиеспецифическиеправила, регулирующие названия сортов и линий культивируемых растений

РАЗДЕЛ I «ПРИНЦИПЫ» формулирует девять базовых принципов, согласно «Биокодексу» составляющих основу научной номенклатуры: свобода таксономических решений, биномиальность (здесь обозначена как «бинарность») видовыхназваний, типификация(исключаянекоторыетаксонывысшихкатегорий), приоритет (предшествование по дате), моносемия (особо оговаривается – независимо от состава, положениявсистемеирангатаксона), латинизация, стабильность названий, следование традиции в непредусмотренных настоящим Кодексом случаях, ретроактивность. Как видно, в «Биокодексе» нет принципа независимости номенклатурныхнормдляразныхцарстворганизмов.

РАЗДЕЛ II «ПРАВИЛА» поделён на пять глав.

Глава I «Таксоны и ранги» включает три статьи, в которых определены основные понятия: таксон (включает тотальные организмы) и паратаксон (включает отдельные части организмов, отдельные жизненные циклы и т.п.) (ст. 1); первичные ранги – царство, тип/отдел, класс, отряд/порядок, семейство, род, вид (ст. 2); вторичныерангииранговыегруппы– выше группы семейства, семейственная (включает просемейство), инфрасемейственная (включает подсемейство, трибу, подтрибу), родовая (включает прород), инфрародовая (включает подрод, секцию и подсекцию, серию и подсерию), видовая (включает провид), инфравидовая (ст. 3). Как видно, категоризация ранговых группзаимствованавосновномизботанической номенклатуры, но более дробная. Следует отметить, чтовданномКодексевпервыевведены вторичные категории просемейства, пророда и провида.

Глава II «Названия (общие условия)» со-

держит правила образования, присвоения и измененияназваний, поделенанашестьсекций.

В Секции 1 «Статус» определены ос-

новные категории названий – установленные

(established), признаваемые (acceptable) и при-

знанные (accepted) (ст. 4); эта категоризация во многом соответствует принятой в «Фило-

считаются интеркалярными. В ботанических биноменах родо-видовая тавтонимия не допускается.

Глава IV «Условия для особых групп»

регламентирует обозначения гибридных форм (ст. 30, со ссылкой на специальные кодексы) и названия паратаксонов (ст. 31).

ГлаваV «Орфографияиграмматический родназваний» (ст. 32–34) иГлаваVI «Автор-

ство названий» (ст. 35) вполне стандартного «ботанического» содержания без каких-либо специфических особенностей.

В РАЗДЕЛЕ III «АВТОРИЗАЦИЯ» указаны меж-

дународныеколлегиальныеорганы, которыеответственнызарегулированиевопросов, связанныхсразработкой, изменениемиприменением «Биокодекса». В их числе – Международный союз биологических наук и Международный союз микробиологических обществ, координируемые в отношении номенклатурыМеждународным комитетом по биономенклатуре. Он действует в тесном сотрудничестве с международными комиссиями по соответствующим специальным кодексам.

Примечание. Следует ещё раз упомянуть «Амстердамскуюдекларациюпономенклатуре грибов» (2011 г.), подготовленную и изданную ведущими микологами мира. В ней рассмотрены правила, касающиеся образования названий грибов (главным образом плеоморфных), с предложением учесть их при подготовке следующей версии «Биокодекса» или в форме издания особого «Микокодекса» (Hawksworth et al., 2011).

2.6. ФИЛОГЕНЕТИЧЕСКАЯ НОМЕНКЛАТУРА

Филономенклатура как самостоятельный раздел таксономической номенклатуры разрабатывается с начала 90-х гг. ХХ в. Она решает в сущности ту же задачу, что и «Биокодекс»,

– представляет собой единую системы номенклатуры для всех разделов биологической систематики, хотя и на существенно иной «идеологической» основе. Данная номенклатурнаясистем, оформленнаякак«Филокодекс», призвана привести описательный язык систематики в соответствие современному состоянию систематики, ориентированной главным образом на филогенетическую концепцию

(Queiroz, 1992, 2005; Queiroz, Gauthier, 1994).

Её основной идеолог и разработчик – американский зоолог Кевин де Куэйрос, поэтому по старой доброй традиции эту номенклатуру

иногданазывают«куэйровской» (Queirauthian) (Dubois, 2005).

Перваяверсия«Филокодекса», послеобсуждения на съезде его разработчиков в Гарвардскомуниверситете(1998 г.), обнародуетсяв2000 г., за ней следуют ещё несколько (2003–2004, 2006, 2007, 2010 гг.), они официально опу-

бликованы в Интернете на сайте «Филокодекса»; обсуждается следующая версия. Для разработки проекта этого кодекса на Втором международном съезде по филогенетической номенклатуре (Париж, 2004 г.) учреждены одноимённыеМеждународноеобществоипри нём Международный Комитет, регулирующий разработку и применение филономенклатуры. Предполагается, что«Филокодекс» будетвведён в действие одновременно со специфическим номенклатором «Филонимы…» (Phylonyms: a Companion to the PhyloCode), содержащим зарегистрированные названия всех филогенетических таксонов живых организмов.

Намоментподготовкинастоящейкнигиофициально принятой Комитетом является версия

4с «Филокодекса» (Cantino, Queiroz, 2010), в

стадииразработкинаходитсяверсия5-бета(до- ступнавИнтернете). Этапоследняясоставляет основудалееизлагаемогообзора. Официальногорусскоязычногоперевода«Филокодекса» нет.

Общая структура этого Кодекса более всего сходнастаковойКодексаботаническойноменклатуры и «Биокодекса»: выделены основные разделы Преамбула, Принципы и Правила; их дополняют Словарь и три Приложения.

В ПРЕАМБУЛЕ (6 пунктов) сказано, что настоящий Кодекс применяется к современным и ископаемым кладам всех организмов; может действовать одновременно с традиционными кодексами; в признании законности (валидности) ранеевведённыхназванийопираетсянаэти кодексы, но по-своему регулирует введённые на их основе названия; названия, не соответствующие условиям «Филокодекса», не имеют официального статуса в филономенклатуре. Отдельным пунктом указывается, что Кодекс вступает в силу одновременно с публикацией специфического номенклатора (Phylonyms: a Companion to the PhyloCode).

Среди ПРИНЦИПОВ (7 пунктов) основные следующие (здесь указаны русскоязычные термины, принятые в настоящей книге): 1) десигнация(reference) – названияпредназначены дляобозначениятаксонов, нонедляуказанияих признаковит.п.; 2) точность(clarity) – названия

должны однозначно указывать таксоны, что достигаетсястрогимопределениемпоследних; 3) моносемия (uniqueness) – для обеспечения точности каждый таксон должен обозначаться единственным признанным названием; 4) стабильность – названия таксонов не должны меняться со временем; 5) «филогенетичность»

(phylogenetic context) – Кодекс имеет дело с именованием филогенетически определённых таксонов; 6) таксономическаясвобода– кодекс не ограничивает свободу взглядов на гипотезы о родственных связях, он только регулирует использование названий в контексте соответствующей филогенетической гипотезы; 7) отвержение прецедентности (no “case law”) – номенклатурныепроблемырешаютсяКомитетом по филогенетической номенклатуре (CPN) посредствомпрямогоприменениястатейКодекса.

Как видно, «Филокодекс» прокламирует приверженность номиналистической концепции номенклатуры (п. 1) и ограничивает сферу своего применения только филогенетически заданным контекстом (п. 5). Некоторые принципы, в традиционных кодексах включаемые

в вводный раздел (латинизация, приоритет = предшествование), в«Филокодексе» низведены до частных правил. Поскольку данный Кодекс претендует на статус общебиологического, в нём, какив«Биокодексе», отсутствуетпринцип независимости предметных кодексов.

В РАЗДЕЛЕ «ПРАВИЛА» (22 статьи) выделены следующиеглавы: 1– Таксоны, 2– Публикации, 3– Названия (с двумя секциями), 4– Регистрация, 5– Выборпризнанногоназвания, 6– Правиладлягибридов, 7– Орфография, 8– Авторство названийиопределений, 9– Указаниеавторови регистрационныхномеров, 10– Названиявидов, 11– Управление.

Глава «Таксоны» включает определения таксонавобщемслучае(ст. 1), клады(ст. 2), иерархиииранга(ст. 3). Таксонпонимаетсястрого «номенклатурно» как группа организмов или вид, которой (которому) присваивается название; клада– какуникальныйпредок(организм, популяция или вид) и все его потомки. Указано, что в рамках данного Кодекса именуются только клады, но не все клады обязаны быть поименованы. Посколькусистеманоменклатурыявляетсярангонезависимой, отположенияв иерархиинезависитрассмотрениесинонимии, омонимии и предшествования. Но при этом оговаривается, чтоКодекс, нетребуяфиксации рангов, не запрещает их.

Глава «Публикация» распространяется на публикациюкакназваний, такилюбыхноменклатурных актов. Под публикацией (ст. 4) понимаетсяраспространениетекста, прошедшего рецензирование, посредством издания в не менее чем 50 идентичных неизменяемых копиях, собязательнымразмещениемнекоторыхизних в главных библиотеках. Соответственно, публикациейнеявляетсяраспространениетекста только в электронной форме (в Интернете или на компакт-дисках), в рефератах диссертаций, навыставках, внаучно-популярныхизданияхи т.п. Датойпубликацииназвания(ст. 5) считается таковая выхода в свет материала, удовлетворяющего ст. 4.

Глава «Названия» вводит следующие основные категории филонимов (ст. 6), частью сходные с таковыми в «Биокодексе» – установленные (established), предшествующие

(preexisting), конвертированные (converted),

признаваемые (acceptable) и признанные (accepted). Первые получают свой статус после опубликования согласно требованиям ст. 7 данного Кодекса. Вторые соответствуют «законным» (в ботанике), «потенциально валидным» (в зоологии) или «валидным» (в вирусологии) названиям, введённым в действие до вступления в силу настоящего Кодекса; сюда жеотносятсяназвания, нерегулируемыепредметными кодексами (например, рангом выше надсемейства в зоологии). Названия третьей категории (конвертированные) – такие предшествующие, которые установлены согласно данному Кодексу. Признаваемые названия установлены согласно требованиям Кодекса

ине являются несохранёнными младшими омонимами. Наконец, названия становятся признанными, если установлены согласно требованиям данного Кодекса, имеют преимущество перед релевантными омонимами

исинонимами и для них нет свидетельств их несостоятельности в контексте соответствующей филогенетической гипотезы. В ст. 7 разъясняется понятие «установленного» названия: онодолжнобытьопубликованосогласноопределённым требованиям (см. ст. 4), введено его авторомкакназваниеявно выделеннойклады, включено в «Phylonyms…» и удовлетворять условиям ст. 9–11, быть зарегистрированным, орфографическикорректным(см. ст. 17). Установлениеназванияимеетместоодновременнос егоопубликованиемв«Phylonyms…». Наконец, чтобы быть установленным, название должно