Разрешение конкатемеров.
Вирусспецифическая резольваза (продукт гена VII) превращает ветвистые конкатемеры в неветвистые. Ее субстратом являются структуры Холлидея. Нарезание конкатемеров на мономеры сопряжено с упаковкой ДНК в вирусные частицы. Процесс осуществляет вирусная терминаза (гетеродимер gp16/gp17). Для упаковки нужна энергия АТФ. Происходит взаимодействие с одним из белков капсида – портальным белком.
Упаковка типа fullhead.
В ДНК обнаруживаются модифицированные основания: 5-оксиметилцитозин и гликозилированные производные нуклеотидов.

В экспериментах по включению субстратов синтеза нуклеиновых кислот в фаговую ДНК было установлено, что более ранние субстраты включаются в ДНК эффективнее, чем более поздние. При разрушении комплекса ферментов синтез ДНК останавливается.
Был сделан вывод о том, что ферменты образуют единый комплекс, в котором синтез нуклеотидов осуществляется по конвейерному принципу, в итоге нуклеозидтрифосфаты подаются прямо к активному центру полимеразы. Это позволяет использовать малые количества нуклеотидов.
OBP – центр кристаллизации всего комплекса. У EBV и герпесвирусов отсутствует OBP.
Типы затравок при инициации репликации.
1. РНК-затравка. Ее могут синтезировать РНК-полимераза или праймаза.
2. ДНК-затравка. Самозатравочный механизм и рекомбинационный механизм.
3.Нуклеотид-белковая затравка.
Разрезание эквивалентов генома из конкатемерных форм.
1.Cos и Pac-зависимое (специфичное).
2.Неспецифичное (fullhead).


cos



















P P










специфический
разрыв






односторонняя
репликация






Head-to-head


рекомбинация






случайный разрыв
(может быть в обе
стороны)
|
Функция |
Прокариоты |
Эукариоты |
|||||||||
|
E.coli |
λ |
P22 |
φX174 |
Р4 |
Т7 |
Т4 |
human |
SV40 |
HSV |
||
|
(-)цепь |
(+)цепь |
||||||||||
|
1.ОВР |
DnaA |
O |
gp18 |
Pri A,B,C |
A |
α |
(gp1) |
(RNApol) cell |
ORC |
T-Ag |
UL9 |
|
2.Helicase loader |
DnaC |
P |
gp12 |
DnaC, DnaT |
A |
α |
(gp4) |
59 |
Cdc6 |
T-Ag |
UL8 |
|
3.Helicase |
DnaB |
gp12 |
DnaB |
Rep |
α |
gp4 |
41 |
MCM |
T-Ag |
UL5 |
|
|
4.Primase |
DnaG |
α |
gp4 |
61 |
DNApolα |
UL52 |
|||||
|
5.DNApol |
DNApol III α |
gp5 |
43 |
DNApolδ |
UL30 |
||||||
|
6.Proof-reading |
DNApol III ε |
gp5 |
43 |
DNApolδ |
UL30 |
||||||
|
7.Clamp loader |
DNApol III γ |
|
44/62 |
RF-C |
|
||||||
|
8.Clamp |
DNApol III β |
тиоредо-ксин |
45 |
PCNA |
UL42 |
||||||