Материал: 04-19-GP-GenomVariabMarkers
Типы полиморфизма генома:
Пример
распределения повторов в геноме человека
21
Геномика и протеомика
Идентификация и анализ полиморфизма генома:
Секвенирование |
Генотипирование (идентиф-я маркеров) |
(Генетическая дактилоскопия, ДНК типирование)
1.ПДРФ (RELP) - полиморфизм длин рестриктных фрагментов.
2.ПЦР для анализа размера ДНК
3.Гибридизация или ПЦР + гибридизация. Чипгибридизация
22
Геномика и протеомика
Идентификация и анализ полиморфизма генома:
Генотипирование (идентиф-я маркеров)
1. ПДРФ (RELP) - полиморфизм длин рестриктных фрагментов
(Restriction fragment length polymorphism) 1 вариант – рестрикция ДНК + ДНК-
гибридизация
23
Геномика и протеомика
Идентификация и анализ полиморфизма генома:
Генотипирование (идентиф-я маркеров)
2. ПЦР. Например, анализ длин фрагментов с повторами.
Болезнь Хантингтона – Размножение CAG-
кодона (Glu) >36
в гене HTT
ПЦР-анализ VNTRаллеля 6 человек. №6 – гомозита.
STR-локусы хромосом
24
Геномика и протеомика
Идентификация и анализ полиморфизма генома:
Генотипирование (идентиф-я маркеров)
3. Гибридизация или ПЦР+гибридизация. Чип-гибридизация.
25
Геномика и протеомика