Материал: 04-19-GP-GenomVariabMarkers
Типы полиморфизма генома:
II. Инсерции-делеции (инделы)
–Простые инделы – 2 аллеля с наличием-отсутствием.
–Мультиаллельные с переменным кол-вом числа сегментов, разделяются на
2. Минисателлиты
Повторы 10-100 нк, VNTR (variable number tandem repeat polimorphism)
различаются количеством тандемных копий
3. Полиморфизм числа копий 200-2 млн
полиморфизм по наличию или отсутствию мобильных генетических элементов (таких как Alu-повторы, ретротранспозоны семейства LINE, псевдогены)
11
Геномика и протеомика
Ретровирусы
Семейство РНК-содержащих вирусов, преимущественно позвоночных.
Представители (онковирусы):
ВИЧ (подсемейство Лентивирусов)
Вирус саркомы Рауса (с онкогеном src)
Вирус опухоли молочной железы мышей
Геном диплоидный: 2 + цепи mРНК (кепированная поли(А)) 7–10 kb, 2 молекулы ревертазы в икосаэдрическом капсиде, состоящем из внутренных вирус-кодируемых белков.
Капсид окружен оболочкой из цитоплазматической мембраны клетки, от которой отпочковался вирус, модифицированной гликозилированными белками оболочки вируса (продукты гена env).
Вирионы ~80-100 нм в диаметре. Многие содержат онкогены в геноме.
12
Схема генома ретровируса
MMTV (mouse mammary tumor virus - вирус опухоли молочной железы мышей
Только 3 вирусных гена нужны для репликации вируса:
1)gag (группоспецифический антиген), кодирующий внутренние белки вирусной частицы;
2)pol - направляющий синтез протеазы, обратной транскриптазы (также обладающей и активностью РНКазы Н) и интегразы
3) env, который кодирует белки оболочки вируса. |
13 |
|
Цикл развития ретровирусов
RNA → DNA → RNA → polypeptide
IRES – элемент позволяет трансляцию вирусных белков по отдельности с одной мРНК
14
Цикл развития ретровирусов
15