Материал: 04-19-GP-GenomVariabMarkers

Цикл развития ретровирусов

Альтернативнымо сплайсингом образуется как полноразмерная (геномная) РНК, направляющая на рибосомах синтез продуктов генов gag и pol, так и сплайсированная РНК, являющаяся матрицей при синтезе белков оболочки (продукты гена env).

Провирус предпочтительно интегрирует в активнотранскрибируемые участки генома.

После интеграции в зародышевые клетки становится эндогенным (ERV) и передается потомкам:

в геноме человека ERV 5-8%

по-видимому, ретровирусы происходят от

Вариабельность генома: повторы и мобильные генетические элементы

Мобильные генетические элементы (МГЭ) – последовательности с

переменной локализацией. Умеренно повторяющиеся последоват-ти

I. Транспозоны с генами транспозиции

(cut and paste) Транспозазой и Резольвазой. Редкие у человека, например, mariner.

2-3 %

II. Ретротранспозоны – транспозиция через обратную транскрипцию, в геноме. Большая часть в геноме, ~42%.

17

Геномика и протеомика

Вариабельность генома: повторы и мобильные генетические элементы

I.Ретротранспозоны (RT)– транспозиция через обратную транскрипцию, в геноме. Большая часть в геноме, ~42%.

1) без LTR - короткие неавтономные SINE и длинные LINE (L1)

SINE -(Short Interspersed Nuclear Elements) - 80-500 bp, tRNA-производные)

(например, Alu (350 bp) у чел-ка >1 млн, ~5-15% у млекопит.) LINE-(Long - // - , ~6 kb, например, у человека около 500 000 ~ 21% )

2)LTR-содержащие (~100 bp - 5 kb) – отличатся от эндогенных ретровирусов

иих остатков отсутствием гена env. Например, HERV, Ty1/copia и Ty3/gypsy у дрозофилы. Границы между RT и ретровирусами (~8%) размыты

Изменяют активность генов, обеспечивают эволюцию геномов

18

Геномика и протеомика