Для централизации управления войсками Дальсовнарком 11 июля 1918 г. назначил главнокомандующим вооруженными силами Дальнего Востока В.В.Саковича и определил временную организацию его штаба в составе отделов: оперативного, формирования и обучения, учета, вооружения, снабжения, финансового, санитарного, военно-технического, военных сообщений и походной канцелярии. Был учрежден и Военно-революционный комитет Уссурийской железной дороги, в который вошли представители от командования фронта, краевого Совета и железной дороги.
Одновременно с этим к 10 июля 1918 г. развернулись тяжелые бои в районе г. Спасска, где войскам РККА, насчитывавшим ок. 3 тыс. бойцов, 32 пулемета, 8 полевых орудий и 2 бронепоезда противостояли войска белочехов и контрреволюционеров, включавшие 7 тыс. штыков и сабель, полевую артиллерию и 2 бронепоезда. Всего же в крае, по официальным данным Народного комиссариата по военным делам РСФСР, к началу июля 1918 г. насчитывалось до 12 тыс. бойцов.
Противник, используя свое превосходство в живой силе, постоянно наносил удары по позициям войск РККА. Командование Уссурийского фронта, учитывая возникшую возможность окружения с флангов принимает решение отвести войска к ст. Уссури и занять оборону в районе железнодорожного моста через р.Уссури. Здесь фронт временно стабилизировался и части РККА пополняли свои потери за счет поступления маршевых рот.
Центром сосредоточения революционных сил и средств для фронта стал г.Хабаровск Находящийся здесь отдел проходящих рот принимал формирования добровольцев и призывников и сводил их в подразделения и части под командованием таких командиров как И.П.Шевчук, А.К.Флегонтов, Караичев и др. Только в район г. Имана с Хабаровского отдела проходящих маршевых рот было отправлено более 3 тыс. чел. из Амурской и Приморской областей.
В прифронтовой полосе развернулись работы по формированию и обучению новых частей, назначались их командиры и комиссары, создавались органы управления и тыла. Батальоны, получавшие наименования населенных пунктов, представители которых составляли большую часть их личного состава - 1-й и 2-й Хабаровские, Владивостокский, Спасский, Благовещенский батальоны и т.д. В роты и батальоны сводились также отряды Красной гвардии, находившиеся на передовых позициях Моряки Амурской военной флотилии сняли с канонерской лодки «Монгол» пушки и совместно с хабаровскими железнодорожниками оборудовали 2 бронепоезда.
С целью укрепления воспитательной работы в войсках в начале июля 1918 г. в составе дальневосточных войск РККА был создан полевой политотдел штаба Уссурийского фронта, во главе с военным комиссаром фронта М.И. Тайшином.
Реорганизация частей и усиленная боевая учеба усилили количетвенную и качественную боеготовность армии. Так, к концу июля 1918 г. в составе Уссурийского фронта насчитывалось 14 тыс. бойцов и до 80 орудий. Стоит отметить, что в этих четко организованных отрядах личный состав почти целиком состоял из уже из бойцов, имевших боевой опыт.
В ходе тяжелых боев, проходивших с 31 июля по 4 августа 1918 г. на Уссурийском фронте при Каульских высотах войска РККА отбросили противника на расстояние в 40 км. от ст. Уссури и продолжили развивать успех при поддержке сил 2 бронепоездов и флота.
На всем фронте части Красной Армии дрались с огромным подъемом, уверенные в скорой победе. Они пополнялись добровольцами и военнообязанными призывных возрастов. Рабочие хабаровского арсенала, базы Амурской военной флотилии, механических заводов и мастерских Благовещенска, железнодорожники ремонтировали вооружение, строили бронепоезда, производили необходимые армии предметы снаряжения. На поле боя бойцам оказывали помощь перевязочные отряды, руководимые врачами Л. Д. Гелен и О. Д. Соловьевой. Санитарный поезд, начальником которого был врач Львов, эвакуировал раненых в хабаровский военный госпиталь и больницы Хабаровска и Благовещенска. В войсках повысилась дисциплина, они закалялись, приобретали боевой опыт.
Наши войска успешно продвигались вперед. Так, 20 августа на фронте от разъезда Краевский до станции Свиягино войсками РККА был разбит британский батальон. Чтобы спасти чехов от полного разгрома, главнокомандующий корпусом интервентов генерал Отани спешно послал на Уссурийский фронт 12-ю японскую дивизию, которая вступила в бой с частями РККА у с. Духовское 23 августа 1918 г., потеряв при этом 200 чел. Вместе с японцами в этом бою принимали участие английский и французский батальоны, а также 27-й американский полк под командованием полковника Штейера.
Используя решающее превосходство в живой силе и технике, а также тактику обходов, фланговых ударов, заходы в тыл, войска интервентов и контревоюлионных элементов сумели перехватить инициативу, после чего к 26 августа 1918 г. части РККА с боями отошли на правый берег р. Уссури, а через три дня заняли позиции Бикинского оборонительного района.
Крайне тяжелая обстановка в августе 1918 г. сложилась и на Забайкальском фронте. После занятия Иркутска чехи перенесли боевые действия в Забайкалье. Оправившись после разгрома в июньских боях, войска атамана Семенова снова двинулись на Читу с юга, после чего 20 августа части РККА оставили Верхнеудинск, а 26 августа - Читу. Советский Дальний Восток оказался в кольце. К концу августа 1918 г. стало очевидным, что вследствие огромного превосходства объединенных сил белогвардейцев и интервентов отразить натиск своими силами советские войска на Дальнем Востоке не в состоянии.
Вследствии этого, 25 августа 1918 г. в Хабаровске открылся V Чрезвычайный краевой съезд Советов - последний краевой съезд первого периода Советской власти на Дальнем Востоке. Одновременно на ст. Урульга проходила конференция партийных, советских и военных работников Забайкалья и Центросибири. И съезд в Хабаровске, и конференция в Урульге, всесторонне оценив обстановку, приняли единственно возможное решение: перейти к партизанским формам борьбы, использовать все возможности для разгрома контрреволюции и иностранной интервенции.
Ликвидацию фронта и отвод сил в горно-таежные районы планировалось проводить последовательно, с тем, чтобы партийные, советские и военные органы имели время, необходимое для организациипартизанских баз и штабов и перехода их на нелегальное положение. Для обеспечения организованного отступления советских частей на фронт выехала специальная делегация, избранная V Чрезвычайным краевым съездом Советов. Однако противнику удалось прорваться по линии железной дороги и 4 сентября занять Хабаровск. К сентябрю часть войск Уссурийского фронта и остатки советских отрядов Забайкалья сосредоточились в районах Благовещенска, Свободного и Зеи. Прорвавшиеся сюда в середине сентября из Маньчжурии по Амуру японские и белогвардейские отряды заняли 18 сентября Благовещенск и на следующий день - поселок Зея.
Таким образом, Советская власть просуществовала на Дальнем Востоке в 1917-1918 гг., однако, несмотря на сложность военно-политической обстановки, дальневосточные части РККА проявили доблесть.
С сентября 1918 г. начался новый период гражданской войны на Дальнем Востоке. Он продолжался по февраль- март 1920 г. Это был период борьбы против американо-японских интервентов и белогвардейцев. Ввиду захвата ими основных жизненных центров края строительство регулярных вооруженных сил здесь прервалось и борьба велась в форме партизанской войны.
ЦК РКП(б) направлял политическую и военную деятельность подпольных партийных организаций Сибири и Дальнего Востока. Непосредственно партизанским движением с первых дней руководили созданное 17 декабря 1918 г. Сибирское бюро ЦК РКП (б), Дальневосточный, Амурский, Читинский, Верхнеудинский подпольные комитеты РКП (б) .
Подпольные комитеты РКП (б), сочетая легальную и нелегальную работу, направляли усилия дальневосточных большевиков и трудящихся масс на развертывание повстанческого движения, укрепление партизанских отрядов, дезорганизацию колчаковского тыла. Боевой программой действий в организации и ведении партизанской войны в крае были решения VIII съезда РКП (б), определившего политику партии в военной области, а также 1, 2 и 3-я Сибирские конференции РКП (б) (август и сентябрь 1918 г., март 1919 г.).
Пройдя несколько этапов в своем развитии, партизанское движение выросло в крупную боевую силу и оказало большую помощь Красной Армии, наносившей главный удар по интервентам и белогвардейцам. К осени 1919 г. в Приморье, Приамурье и Забайкалье действовали до 200 партизанских отрядов и групп, в которых сражалось свыше 50 тыс. бойцов.
Руководство партизанской войной осуществляли областные и волостные военно-революционные штабы, созданные при соответствующих партийных комитетах, городские и сельские революционные комитеты. Они возглавили организацию и руководство боевыми группами, партизанскими отрядами и партизанскими районами. К лету 1919 г. общая численность партизан, объединенных единым командованием, составляла здесь до 4-5 тыс. человек.
Интервенты и белогвардейцы не раз бросали против партизан крупные силы из Владивостока и Никольск-Уссурпйска. Но, несмотря на это, партизанское движение разрасталось, охватывая все новые районы. Летом и осенью 1919 г. партизаны Приморской области разрушили более 350 железнодорожных мостов, в том числе 40 металлических, сбросили под откос 15 воинских эшелонов, повредили связь на многих участках.
Славными подвигами отличились партизаны Приамурья. Выступление против колчаковского режима здесь началось с восстания рабочих и гарнизона Хабаровска в ночь на 28 января 1920 г., когда 3-я и 4-я сотни казачьего полка, часть артиллерийского дивизиона, саперы и пулеметная команда, к которым присоединились рабочие дружины, обезоружили роту юнкеров, арестовали офицеров и двинулись к центру города, чтобы захватить штаб Калмыкова. Атаман сбежал в расположение японцев и поднять там тревогу. Японские и американские войска заняли все выходы из города и отрезали повстанцам пути отхода. Восставшие части были интернированы, а затем помещены в американский концентрационный лагерь на Красной речке.
Особенно значительные операции приамурских партизан против войск интервентов и колчаковцев начались с мая 1919 г. Несколько партизанских отрядов, действовавших в районе Хабаровска, Бикина, 19 мая организовали успешный налет на японский гарнизон на станции Верино и охрану железнодорожных мостов через реки Хор и Кия.
На левом берегу Амура успешно действовал партизанский отряд, организованный в районе Тунгуски грузчиком Хабаровского речного порта И. П. Шевчуком. Внезапными и частыми налетами в районе между реками Амур и Тунгуска и Амурской железной дорогой он наносил ощутимые удары по японским и белогвардейским войскам.
В борьбу с белогвардейцами активно включились и отряды народных мстителей низовья Амура. Этому во многом способствовала объединительная конференция, которая проходила 1-2 ноября 1919 г. в селе Анастасьевка Хабаровского уезда. Представители партийных комитетов и партизанских отрядов образовали объединенный Военно-революционный штаб партизанских отрядов Хабаровского, Никольского уездов и Сахалинской области и приняли решение о подготовке к решающим боям с белогвардейцами и интервентами.
На основе решения объединительной конференции в начале ноября 1919 г. в низовья Амура были направлены из района Хабаровска три небольших партизанских отряда. Красные партизаны в условиях суровой зимы за два месяца преодолели более 900 верст. По пути следования к отрядам присоединились не только русские рабочие и крестьяне, но и часть жителей стойбищ малых народов Амура.
Активизировалась борьба партизан Приамурья в районе Хабаровска. Уже в декабре 1919 г., действуя по единому плану, приамурские партизаны разрушили телефонную связь и вывели из строя значительную часть мостов и других сооружений на железной дороге между станциями Бикин и Бира на протяжении 420 км.
Широкий размах приняли действия партизан Амурской области. Отряды имели твердое партийное руководство, умело и мужественно действовали по линии железной дороги и в бассейнах рек Зея и Бурея. В их рядах сражалось немало бойцов, отошедших сюда с Уссурийского и Даурского фронтов.
Сигналом к вооруженному выступлению против японских оккупантов в Амурской области послужило восстание крестьян села Мазаново, которые 7 января 1919 г. перебили японский гарнизон. Подпольный обком РКП(б), руководимый талантливым вожаком амурских коммунистов Ф. Н. Мухиным, свел отряды в партизанскую армию. Ее командующим был назначен участник июльских боев с белочехами Г. С. Дрогошевский. Японское командование, получив данные о сосредоточении партизанских отрядов в районе д. Чудиновка, спешно двинуло туда пехотные полки, стремясь окружить и уничтожить партизанскую армию. В ночь на 16 февраля у разъезда Юхта начался бой. Почти все находившиеся в них солдаты были перебиты.
Однако опыт боев показал, что, несмотря на храбрость и мужество бойцов, партизанская армия одними своими силами не может освободить от оккупантов Амурскую область. Поэтому, выполняя указание ЦК РКП(б) необходимости подчинения и соразмерности партизанского движения главным средствам борьбы, Амурский военно-революционный штаб разделил партизан на небольшие отряды численностью не свыше 200 человек. Закончив рассредоточение, партизаны в августе - сентябре 1919 г. провели по единому плану крупную совместную операцию на Амурской железной дороге, получившую ироническое название «Капитальный ремонт Амурки». Боясь партизан и опасаясь за свои коммуникации, японское командование во второй половине 1919 г. начало стягивать свои войска в крупные города и железнодорожные станции. Численность партизан в области к этому времени достигла 12 тыс. человек.
В действиях забайкальских партизан в 1919-1920 гг. преобладали удары крупных соединений в соответствии с единым планом. В апреле 1919 г. из «лесных коммун» образуются четыре кавалерийских полка, насчитывавшие до 2 тыс. бойцов, главным образом конников. Партизаны в мае - июне провели ряд операций, наиболее крупными из которых были налеты на Нерчинский и Газимурский Заводы, двухдневный бой над Горным Зерентуем, разгром в июне 1919 г. 7-го и 8-го белогвардейских семеновских полков над Газимурским Заводом, сокрушительный удар по семеновской кавалерии около станции Богдать. В Забайкалье сражались и наносили удары по тылам врага свыше 40 партизанских отрядов общей численностью до 25 тыс. человек.
В сентябре 1919 г. партизанские отряды образовали огромный Восточно-Забайкальский фронт, освободив от семеновцев и японцев большую территорию по рекам Шилка и Аргунь, район Нерчинского Завода, железной дороги на Маньчжурию, в долинах рек Ингода, Опои и Хилок.
Новый период в действиях партизан Дальнего Востока начинается с конца 1919 г., когда на Восточном фронте войска РККА переняли инициатиу.
Перед дальневосточными большевиками встал вопрос о подготовке и проведении всеобщего восстания и установлении Советской власти на всем Дальнем Востоке. Дальневосточный комитет РКП (б) в январе 1920 г. приступил к непосредственной подготовке восстания во Владивостоке. Она велась под лозунгом временной передачи власти Приморской областной земской управе, так как создание Советов во Владивостоке в то время было невозможно без вооруженной борьбы с войсками интервентов. Для руководства подготовкой и проведением восстания обком партии учредил объединенный оперативный штаб военно-революционной организации (ООШ). Его начальником был назначен С. Лазо, секретарем - И. Мамаев, членами - И. Кушнарев, Л. Коровин. ООШ развернул большую работу по организации районных военно-революционных штабов, рабочих боевых ячеек и по пропаганде среди белогвардейских войск. Во всех пяти административных районах Владивостока были сформированы подпольные рабочие дружины.
Под влиянием большевиков начался массовый переход солдат в ряды партизан. Только за последнюю декаду января в Южном Приморье партизанские отряды выросли на 20 тыс. человек. Вышли из повиновения и перешли на сторону народа 34-й и 35-й стрелковые полки. 26 января 1920 г. был освобожден Никольск-Уссурийск.