Примечание. Достигнутый уровень значимости при сравнении распределения генотипов (*) и частоты аллелей (**) в группах сравнения 1 и 2. n - численность выборок, Х2 с поправкой Йейтса.
Анализ распределения генотипов показал, что наиболее распространенным генотипом по полиморфизму rs3104413 в группе больных СД 1-го типа является С/С (69,6%), тогда как в контрольной группе чаще встречался гомозиготный вариант G/G (41,1%). В ходе исследования установлено, что преобладающим аллелем полиморфизма rs3104413 в популяции якутов является аллель G (52,9%), при том что в ранее исследованных выборках популяций мира установлено преобладание частоты мутантного аллеля С (78-92%) [5]. Таким образом, мутантный аллель С для якутов может использоваться в качестве маркера повышенного риска развития СД 1 (OR - 4,036; 95% CI: 2,71-6,02; р<0,001).
Выявлено, что самым распространенным генотипом полиморфного варианта rs2854275 в группе контроля является гомозиготный генотип G/G (88,5%), а в группе больных СД 1-го типа - генотип G/Т (56,3%). Анализ отношения шансов показал, что частота встречаемости аллеля Т в группе людей с СД 1-го типа статистически достоверно выше (44,8%), чем среди людей, не страдающих сахарным диабетом 1-го типа (5,7%), что позволяет считать носительство аллеля Т предрасполагающим фактором к развитию СД 1-го типа (OR= 13,8; 95% CI: 7,48-25,46; р<0,001).
Полиморфный вариант rs9273363 характеризовался достоверно низкой частотой аллеля А (1,5%) в группе здоровых индивидов по сравнению с группой больных СД 1-го типа (53,6%). Отношение шансов (OR) риска развития заболевания для носителей аллеля А составило 76,15 (95% CI:24,89-233,02; р<0,001).
Результаты анализа распределения частот генотипов rs3104413 в сочетании с генотипами полиморфизмов rs2854275, rs9273363 среди больных СД 1-го типа и контрольной выборки представлены в таблице 5.
Таблица 5
Частота встречаемости генотипов полиморфизмов rs3104413, rs2854275, rs9273363 среди больных СД 1-го типа и контрольной выборки
|
Вариант сочетания генотипов, № |
rs3104413 |
rs2854275 |
rs9273363 |
Частота в группе СД 1го типа, абс. (%) |
Частота в контрольной группе, абс. (%) |
RR (95% CI) |
р |
|
|
1 |
С/С |
T/T |
- |
14 (15,2) |
0 |
3,692 (3,055 - 4,463) |
<0,001 |
|
|
2 |
С/С |
G/G |
- |
8 (8,7) |
68 (32,4) |
0,283 (0,144 - 0,557) |
<0,001 |
|
|
3 |
С/С |
G/T |
- |
42 (45,7) |
8 (3,8) |
4,234 (3,212 - 5,58) |
<0,001 |
|
|
4 |
G/G |
- |
А/С |
12 (13) |
0 |
3,625 (3,008 - 4,368) |
<0,001 |
|
|
5 |
G/G |
- |
C/C |
0 |
88 (41,9) |
0,000 |
<0,001 |
|
|
6 |
С/G |
G/G |
А/А |
2 (2,2) |
0 |
3,333 |
0.170 |
|
|
(2,804 - 3,962) |
||||||||
|
7 |
С/G |
G/G |
А/С |
6 (6,5) |
0 |
3,442 (2,881 - 4,113) |
0.002 |
|
|
8 |
С/G |
G/G |
C/C |
0 |
40 (19) |
0,000 |
<0,001 |
|
|
9 |
С/G |
G/T |
C/C |
2 (2,2) |
4 (1,9) |
1,096 (0,349 - 3,444) |
0.769 |
|
|
10 |
С/G |
G/T |
А/С |
4 (4,3) |
0 |
3,386 (2,842 - 4,036) |
0.013 |
|
|
11 |
С/G |
G/T |
А/А |
2 (2,2) |
2 (1) |
1,656 (0,612 - 4,478) |
0.759 |
Всего выявлено 11 вариантов сочетаний генотипов полиморфизмов rs3104413, rs2854275, rs9273363. В группе больных с СД 1-го типа наиболее часто встречались варианты № 3, 1 и 4, тогда как в группе контроля чаще отмечались № 5, 2 и 8.
Заключение
Наиболее высокими показателями относительного риска среди сочетаний генотипов являлись С/С полиморфизма rs3104413 в сочетании с гетерозиготным генотипом G/T полиморфизма rs2854275 - RR = 4,234 (р<0,001); генотип С/С полиморфизма rs3104413 в сочетании с генотипом Т/Т полиморфизма rs2854275 - RR = 3,692 (р<0,001); генотип G/G полиморфизма rs3104413 в сочетании с генотипом А/С полиморфизма rs9273363 - RR = 3,625 (р<0,001).
Таким образом, полученные данные могут быть использованы в качестве биологических предикторов развития СД 1-го типа с целью проведения своевременных персонализированных профилактических мероприятий.
Список литературы
1. Дедов И.И., Шестакова М.В., Викулова О.К. Эпидемиология сахарного диабета в Российской Федерации: клинико-статистический отчет по данным Федерального регистра сахарного диабета // Сахарный диабет. 2017. Т. 20. № 1. С. 13-41. DOI: 10.14341/DM8664.
2. Atkinson M.A. The pathogenesis and natural history of type 1 diabetes. Cold Spring Harbor perspectives in medicine. 2012. Vol. 2. no. 11. P. a007641. Published., DOI:10.1101/cshperspect.a007641.
3. van Belle T.L., Coppieters K.T., von Herrath M.G. Type 1 diabetes: etiology, immunology, and therapeutic strategies. Physiological reviews. 2011. Vol. 91. no. 1. P. 79-118. DOI: 10.1152/physrev.00003.2010.
4. Rich S.S., Concannon P. Role of Type 1 Diabetes-Associated SNPs on Autoantibody Positivity in the Type 1 Diabetes Genetics Consortium: Overview. Diabetes care. 2015. Vol. 38. no.
2. P. S1-S3. DOI: 10.2337/dcs15-2001.
5. Сайт «1000 геномов» [Электронный ресурс]. URL: http://www.internationalgenome.org/ (дата обращения: 20.01.2019).