МикроРНК в онкогенезе и диагностике глиом головного мозга
Ступак Е.В.1, Титов С.Е.2,3, Веряскина Ю.А.2, Ахмерова Л.Г. 2, Ступак В.В.1, Рабинович С.С.1, Долженко Д.А.1, Жимулёв И.Ф.2
1Новосибирский НИИ травматологии и ортопедии им. Я.Л. Цивьяна, Новосибирск
2Институт молекулярной и клеточной биологии СО РАН, Новосибирск
3ЗАО «Вектор-Бест», Новосибирск
Современные литературные источники, описывающие диагностическую значимость микроРНК, выявляемых в глиомах головного мозга, не содержат четкой систематизации результатов с описанием профилей микроРНК, которые могут соответствовать различным гистотипам глиом головного мозга. В данной статье, основанной на анализе 50 научных источников и собственных исследованиях, проведена систематизация данных об экспрессии наиболее исследованных микроРНК глиом головного мозга. Изложена их роль в онкогенезе глиом. При глиомах низкой степени анаплазии (Grade I-II) выявлено снижение уровня экспрессии онкосупрессорных микроРНК-7, -137, -153, -181 и -128 в сравнении с паратуморозной тканью. А экспрессия онкосупрессивной микроРНК-9 повышается в обоих типах опухолей. Для онкогенных микроРНК-21 и -221/222 есть корреляция между уровнем экспрессии и степенью злокачественности глиом. Однако статистически достоверных различий, позволяющих отличить глиомы Grade I от Grade II, в настоящий момент не выявлено. Злокачественные глиомы (Grade III-IV) характеризуются пониженной экспрессией онкосупрессорных микроРНК-7, -31, -137, -153, -181, -128, -124, при этом для онкогенных микроРНК-21, -23а, -221/222 и онкосупрессивной микроРНК-9 характерны повышенные уровни экспрессии по сравнению с паратуморозной тканью. По уровням экспрессии некоторых микроРНК глиомы разной степени злокачественности не только отличаются от паратуморозной ткани, но и отличаются друг от друга.
Ключевые слова: нейрохирургия, нейроонкология, глиомы головного мозга, микроРНК.
MICRORNA IN ONCOGENESIS AND DIAGNOSTICS OF BRAIN GLIOMAS
Stupak E.V.1, Titov S.E.2,3, Veryaskina Y.A.2, Akhmerova L.G.2, Stupak V.V.1, Rabinovich S.S.1, Dolzhenko D.A.1, Zhimulyov I.F 2
1Novosibirsk Research Institute of Traumatology and Orthopedics n.a. Ya.L. Tsivyan, Novosibirs
2FGBU Institute of Molecular and Cell Biology, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences, Novosibirsk
3ZAO Vector-Best, Novosibirsk
Currently available articles do not demonstrate any clear systematization of the results featuring description of the microRNA profiles, which can correspond to different histotypes of brain gliomas. In this article based on the analysis of 50 scientific sources and our own researches, we systematize the data of the most studied microRNA expressed in the brain gliomas. Also, their role in gliomas oncogenesis is described. There is a decreasing of expression level of the oncosuppressor microRNA-7, -137, -153, -181, and -128 in low-grade gliomas (Grade I-II) compared to paratumorous tissue. An expression of oncosuppressive microRNA-9 is increased in both types of tumors. There is a correlation between the level of expression of oncogenic microRNA- 21 and -221/222 and the degree of tumor malignancy. However, no statistically significant differences distinguishing Grade I from Grade II gliomas have been identified at this time. Malignant gliomas (Grade III- IV) are characterized with a decreased expression of oncosuppressor microRNA-7, -31, -137, -153, -181, -128, and -124 in the tumors, while oncogenic microRNA-21, -23a, -221/222, and oncosuppressive microRNA-9 demonstrate an increased expression levels compared to paratumorous tissues. Gliomas of different grades differ by level of expression of some microRNAs not only from paratumorous tissue, but from each other also. Keywords: neurosurgery, neurooncology, brain gliomas, microRNAs.
В развивающихся странах, в том числе в Российской Федерации, прослеживается четкая тенденция к увеличению заболеваемости опухолями центральной нервной системы (ЦНС) [1]. Частота всех первичных опухолей головного и спинного мозга оценивается от 13 до 18 случаев на 100 000 человек в год [2]. Глиомы являются наиболее распространенными первичными опухолями, и на них приходится около 50% опухолей ЦНС, среди которых наиболее часто встречаются астроцитомы [3].
Термин «глиома» был предложен в 1863 году немецким ученым Рудольфом Вирховом [4]. Сейчас под термином «глиома» понимают часть опухолей нейроэпителиального происхождения, ведущих свое происхождение из астроцитарного или олигодендроглиального ростка. Классификация глиальных опухолей основывается исходя от степени их анаплазии, их разделяют на: медленнорастущие глиомы или глиомы низкой степени злокачественности (low-grade glioma I-II) и (high-grade glioma III-IV) глиомы высокой степени злокачественности, они относятся к быстрорастущим опухолям [5].
Выживаемость у пациентов с опухолями низкой степени злокачественности в настоящее время приближается к 80 месяцам. У больных с анапластической астроцитомой медиана выживаемости составляет порядка 30, а в случае глиобластом - от 10 до 14 месяцев с момента установления диагноза [3].
Несмотря на применение высокотехнологической хирургической помощи, направленной на полное удаление клеток внутримозговых опухолей, достичь последнего не всегда удается. Это связано с рядом факторов, например, опухоль часто локализуется в функционально важных областях мозга, вмешательства в которые могут привести к тяжелой инвалидности пациентов. Кроме этого, глиомы имеют высокую способность к инфильтративному росту, что в момент их удаления затрудняет различение опухолевой ткани и интактной ткани мозга. Даже при удалении всего опухолевого узла в паратуморозной зоне остаются опухолевые клетки, которые дают последующий рост, что приводит к рецидиву заболевания. Поэтому после максимально возможного микрохирургического удаления опухоли проводится лучевая и химиотерапия, а также другие адъювантные методы лечения [6; 7].
На выбор оптимальной комплексной терапии глиальных опухолей в первую очередь влияет правильная оценка степени их злокачественности. Такая оценка делается на основании гистологического исследования опухолевых препаратов, полученных в результате микрохирургического удаления внутримозгового объемного образования или проведения стереотаксической биопсии. Критериями для оценки степени анаплазии выступают: ядерный атипизм, число патологических митозов, пролиферативная активность эндотелия в сосудах и наличие некроза опухоли. В ряде случаев для уточнения диагноза определяют молекулярный тип опухоли, для этого проводят иммуногистохимическое исследование новообразования: измерение активности теломеразы, анализ уровней экспрессии GFAP, VEGF, IGF1 и рецепторов к ним, Ki-67 и других маркеров злокачественных опухолей ЦНС [8; 9].
Ранее гистологический метод для большинства опухолей был основным инструментом диагноза, позволяющим сделать долгосрочный прогноз. Однако при верификации патоморфологического диагноза и определении степени злокачественности глиальных опухолей возникают диагностические ошибки, достигающие от 38 до 64% в ведущих клиниках [10].
Развитие молекулярной нейроонкологии привело к тому, что в настоящий момент молекулярно-генетический профиль опухоли занимает одно из важных мест в классификации опухолей, в первую очередь глиальных, потому что лучше коррелирует с прогнозом, чем гистологическая характеристика опухоли. Об этом свидетельствует опубликованная ВОЗ в 2016 году дополненная гистологическая классификация опухолей центральной нервной системы [11]. Предлагаемые дополнения касаются нейроэктодермальных опухолей. Классификация включает в себя не только гистологическую характеристику опухоли, но и её молекулярно-генетический профиль. По мере накопления данных о генетическом профиле новообразований, имеющих свою прогностическую и диагностическую значимость, классификация, несомненно, будет пополняться и совершенствоваться. Одним из перспективных направлений в ее совершенствовании и, соответственно, в оптимизации комплексного лечения больных со злокачественными супратенториальными глиомами головного мозга является изучение роли микроРНК в процессах онкогенеза головного мозга. онкогенез диагностика глиома мозг
МикроРНК - это короткие некодирующие РНК, около 20-22 нуклеотида, которые участвуют в контроле экспрессии генов, кодирующих белки [12]. Они могут выступать как супрессоры роста опухолей, также могут быть в качестве онкогенов. МикроРНК регулирует большое количество процессов в организме человека. Рост клетки, её пролиферативная активность, инвазия опухоли, её метастазирование, апоптоз, ангиогенез, а также иммунный ответ - все эти процессы регулирует микроРНК [13; 14].
В настоящее время имеются ряд исследований роли отдельно взятых микроРНК в глиомах головного мозга, в которых указывается их диагностическая значимость не только для выявления глиом, но и в установлении степени их злокачественности. Методы исследования, использованные для определения уровня экспрессии микроРНК в большинстве работ, включают: ПЦР в реальном времени, цифровая капельная ПЦР, микрочипы, секвенирование.
К сожалению, опубликованные к настоящему времени работы не содержат четкой систематизации результатов с описанием профилей микроРНК, соответствующих различным гистотипам глиом и степени их злокачественности. Поэтому в нашей статье мы попытаемся провести системный анализ опубликованных данных об экспрессии наиболее исследованных
микроРНК.
Из литературных данных известно, что в тканях глиом низкой степени злокачественности, по сравнению с окружающей тканью головного мозга, имеются разнонаправленные тенденции: наряду со снижением уровней экспрессии онкосупрессорных микроРНК-7, -137, -153, -181, -128 [15-17] имеется повышение этих показателей у микроРНК-9 [15-18]. Для онкогенных, микроРНК-21 и -221/222 прослеживается корреляция между уровнем их экспрессии в тканях опухолей и степенью злокачественности глиом [19; 20]. Однако статистически достоверные различия, позволяющие дифференцировать глиомы Grade I от Grade II по уровням экспрессии микроРНК, в настоящий момент не получены [20].
В глиомах высокой степени злокачественности, по сравнению с паратуморозной тканью, отмечены аналогичные тенденции: понижение уровней экспрессии онкосупрессорных микроРНК-7, -31, -137, -153, -181, -128, -124 [19; 21; 22] и, напротив - повышение этих показателей онкогенных микроРНК-21, -23а, -221/222 [19; 23]. При этом уровень экспрессии был значительно выше в тканях глиобластом по сравнению с глиомами Grade III. Такая же картина, но без достоверных различий, отмечена для микроРНК-9 в глиомах Grade III и Grade IV [18].
По уровням экспрессии некоторых микроРНК глиомы разной степени злокачественности не только отличаются от паратуморозной ткани, но и друг от друга. Так, например, в ряде случаев олигодендроглиому можно отличить от глиобластомы. В последней уровни экспрессии микроРНК-21, -132, -134, -155, -218 и -409-5p в три, а микроРНК-128 в четыре раза выше по сравнению с олигодендроглиомами [24].
Рассмотрим роль вышеуказанных микроРНК в развитии глиом головного мозга более подробно.
Онкосупрессорная микроРНК-7 задействована в регуляции Akt/PI3K-зависимого и Raf/Ras/ERK/MEK-зависимого сигнальных путей, контролируя процессы, отвечающие за рост и малигнизацию опухоли: инвазию, пролиферацию, миграцию, апоптоз. Visani M. с соавторами зафиксировали снижение экспрессии этой микроРНК в глиомах по сравнению с паратуморозной тканью [21].
Уровень онкосупрессивной микроРНК-9 достоверно повышен в группах I-III степени злокачественности по сравнению с условно нормальными прилежащими тканями мозга, однако для глиобластом статистически значимых различий выявлено не было [18].
Повышенная экспрессия микроРНК-9 приводит к значительному увеличению миграции клеток в опухолевой ткани и превалированию над их пролиферацией, это связано со снижением экспрессии NF1 и CREB. Напротив, снижение экспрессии микроРНК-9 ведет к преобладанию пролиферации клеток над их миграционной способностью [25]. Работами Gomez G. с соавторами показано, что мишенью для онкосупрессивной микроРНК-9 является ген FOXP1. Повышение его уровня экспрессии in vitro в культуре клеток U251 и U373 приводило к стимуляции их роста [26].
При увеличении экспрессии микроРНК-9 повышается резистентность к химиотерапии (темозоломиду), это связанно с активацией экспрессии компонентов комплекса SHH множественной устойчивости к лекарствам [27].
МикроРНК-21 является одной из наиболее высокоэкспрессируемых микроРНК в клетках человека, однако ее уровень экспрессии еще больше повышается в тканях глиом
[19] . Результаты множества исследований микроРНК-21 свидетельствуют об увеличении примерно в 5~15 раз уровня экспрессии в тканях глиом по сравнению с нормой [19; 21]. В работе Ступака Е.В. с соавторами также было установлено увеличение уровня экспрессии микроРНК-21 более чем в 5 раз в образцах глиобластом (Grade IV) по отношению к паратуморозной тканям мозга. Аналогичные данные получены, по сравнению с астроцитомами Grade III, и в образцах глиобластом. Таким образом, повышение уровня экспрессии микроРНК-21 в тканях глиом пропорционально степени их злокачественности
[20] . Онкогенный эффект микроРНК-21 в клетках глиомы человека осуществляется через подавление экспрессии генов-супрессоров опухолей, таких как HNRPK, TAp63, JMY, RECK, TOPORS, TP53BP2, DAXX, TGFBR2/3, PDCD4 и TIMP3 [28]. Повышение экспрессии микроРНК ведет к усилению пролиферации, инвазии и снижению апоптоза клеток опухоли. Кроме того, низкий уровень ее экспрессии, по данным атласа ракового генома (TCGA), слабо ассоциирован с повышенной выживаемостью. Ингибирование микроРНК-21 приводит наряду со снижением экспрессии EGFR к остановке клеточного цикла в фазе G1/S и в конечном итоге к торможению роста опухоли [29].
В глиомах высокой степени злокачественности имеется повышенный уровень экспрессии онкогенной микроРНК-23, приводящей за счет ингибирования экспрессии транскрипционного фактора HOXD10, который регулирует экспрессию ММР-14 к активации инвазии глиальных клеток [23; 30]. Tan X. с соавторами отметили, что увеличение роста глиом связано с повышенными показателями экспрессии микроРНК-23а, зависящей от транскрипционного фактора CREB и подавляющей экспрессию гена PTE [31]. Снижение уровней экспрессии микроРНК-23а и микроРНК-21 in vitro в клеточной линии глиомы U138 уменьшало способность опухоли к формированию колоний [23].
МикроРНК-137 является онкосупрессорной, её экспрессия достоверно снижена не только в олигодендроглиальных опухолях II-III, а также и в глиомах III-IV степени злокачественности [15; 32]. Visani M. с соавторами также получили аналогичные результаты, но достоверная разница была найдена в глиомах только между I и IV степенями злокачественности [33]. В процессе увеличения степени злокачественности глиом (особенно в глиобластомах) происходит снижение уровней экспрессии микроРНК-137, приводящее к активации пролиферации и инвазии клеток опухоли [34].