Социально-экономические изменения, происходившие в XII-XIII вв., развитие культуры и появление университетов способствовали распространению образования, что требовало от церкви поиска принципиально нового способа общения с обществом. Как следствие, «Фома Аквинский в XIII столетии создает соответствующий новым временам философско-теологический синтез, в котором придает теологии зрелую форму и создает тем самым классическую средневековую римско-католическую парадигму. Он не только придал теологии Августина принципиально римскую направленность, но и поставил ее с помощью аристотелевской философии на исключительно рациональную основу» [9, с. 254].
Как и другие мыслители, он тоже размышлял над вопросом: если Бог сотворил все и он добр, откуда же зло? Самый известный и значительный труд Фомы Аквинского посвященный данной проблеме - «Сумма теологии» [10]. В ней он выдвигает несколько тезисов касательно проблемы теодицеи.
Во-первых, «зло не является позитивным явлением и не существует само по себе, как добро, а представляет собой просто обычное небытие, ущербность добра» [6, с. 109]. Т.е. понятие зла он выводит из понятия добра, как и Августин. Зло не является бытием, а значит, не имеет «самостоятельного и субстанционального существования» [Там же, с. 110], в отличие от добра.
Во-вторых, добро является источником (субъектом) зла. Как и Августин, он считал, что не существует ничего другого, кроме добра, из которого могло бы родиться зло. Фома считал, что все, а значит и зло, имеют свою причину. Ею может быть только то, что присуще бытию, добру. Зло, являясь небытием, не может быть причиной. Бог, который и есть высшее бытие и добро, не является причиной зла, так как зло основано на несовершенстве поведения субъекта, а Бог - абсолютное совершенство. Нет первичного начала зла: ничто не может быть по своей сущности абсолютным злом. А значит, всякое зло берет начало в благой причине.
В-третьих, в Божьем замысле любая вещь задумана в совершенстве. Но для гармонии в мире необходимы разумные степени совершенства. Наличие несовершенных предметов в мире необходимо для мировой гармонии. Если устранить все зло, то миру недостанет многих благ. Например, без жестокости тиранов невозможна стойкость мучеников.
В-четвертых, «Бог является творцом зла как наказания, а не как вины» [Там же, с. 113]. Человека отличает от животных свободная воля, которая предполагает ответственность за поступки, ведь он способен выбирать между добром и злом. Он считал, что для того, чтобы поступать морально, достаточно иметь истинное знание о добре и зле, т.е. примат интеллекта над верой. У Августина иначе: приоритет воли и чувств над интеллектом.